More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04100 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL04100  conserved hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  34.86 
 
 
306 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  36.67 
 
 
215 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.29 
 
 
947 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 
1163 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.38 
 
 
1363 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.34 
 
 
1221 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 
1481 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.62 
 
 
1364 aa  93.2  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.07 
 
 
1236 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 
696 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.76 
 
 
1553 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.66 
 
 
930 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.53 
 
 
919 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.44 
 
 
1652 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.07 
 
 
1247 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.51 
 
 
737 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.16 
 
 
1193 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 
1474 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.85 
 
 
1510 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.53 
 
 
1004 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31.21 
 
 
1213 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
1196 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.22 
 
 
677 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  27.63 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.73 
 
 
1188 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 
1686 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30 
 
 
790 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  25 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  25 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.02 
 
 
1262 aa  79.7  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.07 
 
 
1789 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25 
 
 
1868 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  32.12 
 
 
540 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.4 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.66 
 
 
1357 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.41 
 
 
1523 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
1831 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.33 
 
 
924 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  25.87 
 
 
316 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
1552 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.19 
 
 
740 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.52 
 
 
642 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  36.51 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  29.12 
 
 
687 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.52 
 
 
842 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.83 
 
 
1217 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.94 
 
 
1807 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 
1858 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  33.13 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.98 
 
 
954 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1190 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  32.93 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 
1211 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.51 
 
 
1208 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.07 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
1760 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.18 
 
 
676 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.61 
 
 
1901 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.65 
 
 
675 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.85 
 
 
1348 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
1878 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 
872 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.97 
 
 
1443 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.92 
 
 
1599 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.94 
 
 
1711 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.14 
 
 
576 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.14 
 
 
792 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.4 
 
 
1399 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.91 
 
 
505 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 
1557 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_2239  predicted protein  33.09 
 
 
514 aa  69.7  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0895904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  32.48 
 
 
504 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.9 
 
 
1242 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.76 
 
 
1229 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  20.82 
 
 
1188 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.84 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.97 
 
 
865 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.48 
 
 
664 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.02 
 
 
742 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  31.47 
 
 
1041 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.21 
 
 
1039 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  36.67 
 
 
1344 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.51 
 
 
1016 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.8 
 
 
1661 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.98 
 
 
1609 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.25 
 
 
630 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.29 
 
 
1454 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.05 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.31 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.13 
 
 
1240 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 
1334 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  31.29 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>