More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1763 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1763  hemin-binding periplasmic protein HmuT  100 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0648  hemin-binding periplasmic protein HmuT  50.73 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1604  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  43.13 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0585  periplasmic binding protein  40.57 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1789  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  42.75 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1972  putative hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein  41.98 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  28.35 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 354 aa  85.9  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0853  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.34 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  26.38 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  25 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  22.48 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.02 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.1 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.1 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.84 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  21.37 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2249  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  22 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  26.71 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6329  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.683898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.79 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  23.74 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  25.3 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.27 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0117  periplasmic binding protein  29.02 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  26.26 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 318 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.31 
 
 		 287 aa  72  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  21.51 
 
 		 328 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.81 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  25 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.05 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  25 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  24.71 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  25.19 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.33 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.19 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  24.33 
 
 		 517 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  21.09 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06810  Periplasmic binding protein  20.6 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  26.33 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0698  vitamin B12-transporter protein BtuF  24.71 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  26.33 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  26.5 
 
 		 409 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  22.87 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.69 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1388  iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  22.8 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.783574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  24.89 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  22.13 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  22.31 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 380 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0798  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.33 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0226  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.75 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  24.03 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.03 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0229  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.75 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0243  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.75 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.03 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  24.03 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>