More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0687 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 311 aa  634    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  64.21 
 
 		 316 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  63.88 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  63.88 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  52.1 
 
 		 315 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  34.63 
 
 		 314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  34.43 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.23 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  31.79 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  33.01 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  32.03 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  32.69 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  28.08 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  28.3 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  32.47 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  28.9 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  28.9 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.1 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 326 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  27.87 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  27.33 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 291 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.45 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  27.57 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  25.09 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  25.49 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  28.85 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  26.91 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  27.63 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  26.62 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  26.32 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  27.63 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  29.41 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  27.81 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  27.21 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  27.92 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  24.65 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  25.82 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  22.48 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.92 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  27.6 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  24.51 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  24.84 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 295 aa  86.3  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  25.25 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  26.23 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  26.38 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  26.72 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  24.18 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  26.49 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  25.08 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  27.14 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  25.32 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  27.83 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  27.17 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>