More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02600 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  100 
 
 
383 aa  794    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  75.41 
 
 
308 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  77.2 
 
 
309 aa  478  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  74.5 
 
 
307 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  74.5 
 
 
307 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  72.85 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  72.85 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  72.85 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  71.01 
 
 
311 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  73.84 
 
 
309 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  68.87 
 
 
308 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  63.4 
 
 
315 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  62.3 
 
 
315 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  33.44 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  35.43 
 
 
310 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.36 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  36.45 
 
 
312 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  36.12 
 
 
312 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  35.12 
 
 
312 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 
337 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  28.2 
 
 
315 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
303 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
294 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 
301 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 
294 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 
318 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 
318 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 
301 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 
301 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 
316 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  30.87 
 
 
300 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  30.55 
 
 
301 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 
320 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 
307 aa  97.1  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 
298 aa  96.7  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 
294 aa  96.7  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 
290 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 
291 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
290 aa  92.8  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
296 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  27.58 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
292 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 
314 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 
303 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  27.69 
 
 
294 aa  89.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 
296 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 
302 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  29.61 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  27.71 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  28.68 
 
 
306 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 
292 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 
293 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  27.07 
 
 
321 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 
309 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 
298 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
296 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 
302 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  28.16 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  27.6 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  25.32 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1452  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.04 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  26.16 
 
 
292 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  24.63 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
307 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.41 
 
 
304 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  27.67 
 
 
292 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 
293 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  24.64 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.69 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>