More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2683 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
308 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 
307 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 
307 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  80.53 
 
 
307 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  80.53 
 
 
307 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 
307 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  78.5 
 
 
309 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  75.41 
 
 
383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  74.68 
 
 
308 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  72.7 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  75.66 
 
 
309 aa  460  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  66.56 
 
 
315 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  67.22 
 
 
315 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  33.66 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  31.48 
 
 
314 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.27 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  35.1 
 
 
312 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  34.42 
 
 
312 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  34.11 
 
 
312 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 
337 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 
292 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
301 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
292 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
301 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  31.41 
 
 
301 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 
300 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 
294 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  29.81 
 
 
294 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 
300 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 
294 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
300 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 
301 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 
290 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 
296 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 
320 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  30.06 
 
 
297 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  27.88 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  25.49 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  30.09 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  29.56 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  28.22 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 
314 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 
293 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
291 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  25.75 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  29.94 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  29.28 
 
 
296 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
307 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 
294 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  26.06 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  25.51 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  26.62 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  25.57 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  25.57 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  27.41 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  26.09 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 
293 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 
301 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>