More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0929 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 315 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  54.55 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  54.21 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  54.21 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  52.7 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  29.09 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.51 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  29.62 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  26.86 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  26.86 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  26 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.06 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 290 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  29.51 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  26.15 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  26.15 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  26.15 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.95 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  32.39 
 
 		 297 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  28.2 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  25.75 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.4 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.35 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  27.38 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  29.35 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.71 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.61 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1032  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0951  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  29.88 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  27.89 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  26.42 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.45 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  30.35 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  28.4 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  28 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  26.96 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  25.2 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  25.2 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  30.59 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3310  dihydrodipicolinate synthase  29.32 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  26.96 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  29.2 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  29.48 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  28.06 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  23.24 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  24.59 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  24.59 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  27.2 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  31.23 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  29 
 
 		 308 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  27.2 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  26.54 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  27.39 
 
 		 294 aa  85.9  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  28.74 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.57 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  28.69 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0791  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0269832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  28.35 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  25.41 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0532  dihydrodipicolinate synthase, putative  22.41 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  25.31 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  27.45 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2466  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.400267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>