More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1393 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
312 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  92.63 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  90.71 
 
 
312 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  77.02 
 
 
310 aa  484  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  67.96 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  40.85 
 
 
314 aa  248  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  37.42 
 
 
309 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  37.09 
 
 
307 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  37.09 
 
 
307 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  36.42 
 
 
307 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  36.42 
 
 
307 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  36.42 
 
 
307 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  37.81 
 
 
311 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  36.93 
 
 
315 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  36.93 
 
 
315 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0466092 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  34.88 
 
 
309 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  34.11 
 
 
308 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  35.12 
 
 
383 aa  156  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 
308 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  32.57 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  31.63 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  30.85 
 
 
316 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  30.17 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.13 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
298 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 
298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 
371 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.16 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  29.1 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  27.8 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.46 
 
 
294 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 
296 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  27.94 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  25.91 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  25.64 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  28.75 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  23.68 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  30.57 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  26.15 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  26.38 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  26.61 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  23.18 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  26.07 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  27.6 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  23.75 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  23.75 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  24.59 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  27.45 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  22.85 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  23.72 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  23.75 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  23.75 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  24.19 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  23.75 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  26.07 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  26.23 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  27.06 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  26.42 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  23.25 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  23.2 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  23.1 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  26.1 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  26.29 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  27.12 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  25.73 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  28.1 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  23.47 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  29.33 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  22.74 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>