More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0601 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0601  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
308 aa  627  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2683  dihydrodipicolinate synthetase  74.68 
 
 
308 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4933  dihydrodipicolinate synthetase  73.6 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3227  dihydrodipicolinate synthetase  73.6 
 
 
307 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6740  dihydrodipicolinate synthetase  73.27 
 
 
307 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1566  dihydrodipicolinate synthetase  73.27 
 
 
307 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6264  dihydrodipicolinate synthetase  73.27 
 
 
307 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5282  dihydrodipicolinate synthetase  72.82 
 
 
309 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3377  dihydrodipicolinate synthetase  74.59 
 
 
311 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02728  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00110)  72.19 
 
 
309 aa  435  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.753115  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02600  dihydrodipicolinate synthase DapA, putative  68.87 
 
 
383 aa  419  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3161  dihydrodipicolinate synthetase  67.88 
 
 
315 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0466092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0071  dihydrodipicolinate synthase  66.89 
 
 
315 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3437  dihydrodipicolinate synthetase  32.01 
 
 
310 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0930984  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0631  dihydrodipicolinate synthetase  29.8 
 
 
314 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000301226  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1167  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.91 
 
 
314 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3342  dihydrodipicolinate synthetase  34.11 
 
 
312 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0058629  normal  0.508652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5676  dihydrodipicolinate synthetase  33.77 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1393  dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1603  dihydrodipicolinate synthetase  29.61 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
300 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6384  dihydrodipicolinate synthetase  31.01 
 
 
318 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6617  dihydrodipicolinate synthetase  31.01 
 
 
318 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.242372 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6215  dihydrodipicolinate synthetase  31.01 
 
 
316 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 
298 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 
300 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
314 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 
332 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 
309 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
290 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 
307 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 
301 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.13 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0929  dihydrodipicolinate synthetase  29 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.626944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
319 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  28.75 
 
 
298 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.16 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
296 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.2 
 
 
294 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1347  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0665282  decreased coverage  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  25.9 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0687  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0101529  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  28.75 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
302 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  29.38 
 
 
297 aa  89  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  27.48 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  25.58 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  26.58 
 
 
296 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  27.09 
 
 
297 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 
300 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 
291 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  30.7 
 
 
330 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>