175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2789 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  76.29 
 
 		 637 aa  983    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 		 642 aa  1313    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  62.44 
 
 		 628 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  53.45 
 
 		 629 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  53.92 
 
 		 629 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  52.35 
 
 		 629 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  52.51 
 
 		 629 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  51.96 
 
 		 633 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  51.5 
 
 		 630 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  51.74 
 
 		 629 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  53.24 
 
 		 629 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  53.08 
 
 		 629 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  53.08 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  53.08 
 
 		 629 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  53.08 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  53.08 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  53.08 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  51.58 
 
 		 654 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  50 
 
 		 629 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  49.92 
 
 		 639 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  48.03 
 
 		 626 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  47.4 
 
 		 627 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  47.4 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  47.56 
 
 		 627 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  45.58 
 
 		 626 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  45.67 
 
 		 626 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  45.58 
 
 		 626 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  45.43 
 
 		 626 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  45.9 
 
 		 626 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  44.95 
 
 		 626 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  42.68 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  42.68 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  42.68 
 
 		 626 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  44.72 
 
 		 641 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  40.54 
 
 		 623 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  40.06 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  40.06 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  40.06 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  40.06 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  40.06 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  39.91 
 
 		 623 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  39.34 
 
 		 623 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  39.75 
 
 		 623 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.4 
 
 		 623 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  38.49 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  37.91 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.16 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  35.31 
 
 		 625 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  35.53 
 
 		 619 aa  360  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  35.28 
 
 		 624 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  35.38 
 
 		 619 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  35.38 
 
 		 619 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  36.39 
 
 		 624 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.6 
 
 		 630 aa  326  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  32.82 
 
 		 638 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.05 
 
 		 612 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  28.82 
 
 		 611 aa  233  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.85 
 
 		 647 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  30.14 
 
 		 616 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  29.55 
 
 		 611 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  29.55 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  29.73 
 
 		 605 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  29.39 
 
 		 611 aa  221  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  28.3 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  29.39 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  29.39 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  29.39 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  29.39 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  29.88 
 
 		 612 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  29.88 
 
 		 612 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  29.72 
 
 		 612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  29.72 
 
 		 612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  29.86 
 
 		 612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  29.55 
 
 		 612 aa  213  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  28.35 
 
 		 606 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  27.71 
 
 		 606 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.17 
 
 		 590 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  29.56 
 
 		 589 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  27.53 
 
 		 606 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  28.06 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.95 
 
 		 609 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.93 
 
 		 652 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.3 
 
 		 590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  28.66 
 
 		 588 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  28.79 
 
 		 586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  27.92 
 
 		 614 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  27.92 
 
 		 614 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  28.21 
 
 		 593 aa  191  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  27.55 
 
 		 614 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  27.99 
 
 		 610 aa  190  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  27.77 
 
 		 611 aa  190  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  26.32 
 
 		 588 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  26.89 
 
 		 588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 621 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  28.99 
 
 		 620 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  26.48 
 
 		 588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  28.55 
 
 		 592 aa  180  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  28.51 
 
 		 621 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  27.71 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  28.57 
 
 		 597 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>