175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3481 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1206    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  62.02 
 
 		 620 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  98.39 
 
 		 621 aa  1185    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  36.73 
 
 		 619 aa  343  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  36.46 
 
 		 619 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  35.06 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  35.46 
 
 		 625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.59 
 
 		 623 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  35.5 
 
 		 629 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  36.79 
 
 		 623 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  35.46 
 
 		 629 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  36.63 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  36.63 
 
 		 623 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  36.63 
 
 		 623 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  36.63 
 
 		 623 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  36.63 
 
 		 623 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  34.62 
 
 		 629 aa  300  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  34.48 
 
 		 627 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  36.48 
 
 		 623 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  34.32 
 
 		 627 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  36.25 
 
 		 620 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  34.17 
 
 		 627 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  34 
 
 		 630 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  31.94 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  35.97 
 
 		 623 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  36 
 
 		 623 aa  294  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  32.4 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  32.4 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  32.4 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  33.44 
 
 		 626 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  33.44 
 
 		 626 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  33.44 
 
 		 626 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.64 
 
 		 629 aa  286  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  35.03 
 
 		 629 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  33.91 
 
 		 626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.74 
 
 		 630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  32.28 
 
 		 626 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  32.86 
 
 		 626 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  35.4 
 
 		 629 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  33.64 
 
 		 624 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  35.4 
 
 		 629 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  35.4 
 
 		 629 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  35.4 
 
 		 629 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  35.4 
 
 		 629 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  35.4 
 
 		 629 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  35.4 
 
 		 629 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.3 
 
 		 624 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.12 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  31.58 
 
 		 629 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  33.39 
 
 		 654 aa  263  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  31.94 
 
 		 624 aa  254  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  32.14 
 
 		 639 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  32.45 
 
 		 638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.35 
 
 		 652 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  29.62 
 
 		 637 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.28 
 
 		 647 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  27.57 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  29.45 
 
 		 633 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  32.85 
 
 		 597 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.88 
 
 		 628 aa  210  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  33.01 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.88 
 
 		 642 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  31.04 
 
 		 597 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  27.98 
 
 		 606 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  28.24 
 
 		 611 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  29.85 
 
 		 641 aa  194  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  29.25 
 
 		 589 aa  193  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  27.44 
 
 		 606 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  26.89 
 
 		 606 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  27.67 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.38 
 
 		 590 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  27.84 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  27.84 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  27.68 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.85 
 
 		 590 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  29.67 
 
 		 586 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  29.08 
 
 		 589 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  30.45 
 
 		 605 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  29.61 
 
 		 592 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  28.88 
 
 		 612 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  28.88 
 
 		 612 aa  173  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  28.73 
 
 		 612 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  28.73 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  29.36 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  28.73 
 
 		 612 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  26.07 
 
 		 589 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.99 
 
 		 612 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  25.31 
 
 		 609 aa  166  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  28.79 
 
 		 587 aa  164  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  28.8 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  28.64 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  26.13 
 
 		 588 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  28.75 
 
 		 611 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  24.88 
 
 		 588 aa  157  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  28.48 
 
 		 611 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  29.58 
 
 		 593 aa  157  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  28.64 
 
 		 611 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  28.64 
 
 		 611 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  28.64 
 
 		 611 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  24.96 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>