175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2596 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  100 
 
 
641 aa  1305    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  48.59 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  47.72 
 
 
628 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  45.14 
 
 
629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  44.72 
 
 
642 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  44.39 
 
 
629 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.89 
 
 
629 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  43.35 
 
 
629 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  43.04 
 
 
629 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  43.01 
 
 
630 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  42.48 
 
 
629 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  43.3 
 
 
629 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  43.15 
 
 
629 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  43.3 
 
 
629 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  43.3 
 
 
629 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  43.3 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  43.3 
 
 
629 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  43.3 
 
 
629 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  42.21 
 
 
633 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40.06 
 
 
626 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  40.91 
 
 
654 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  41.13 
 
 
626 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  41.13 
 
 
626 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  39.44 
 
 
639 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  40.97 
 
 
626 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  41.13 
 
 
626 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  40.6 
 
 
627 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  40.75 
 
 
627 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  40.6 
 
 
627 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  40.44 
 
 
626 aa  422  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  38.93 
 
 
626 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  36.09 
 
 
626 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  36.09 
 
 
626 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  36.09 
 
 
626 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  35.36 
 
 
623 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.91 
 
 
623 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  35.26 
 
 
623 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  35.1 
 
 
623 aa  334  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  35.1 
 
 
623 aa  334  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  35.1 
 
 
623 aa  334  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  35.1 
 
 
623 aa  334  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  35.1 
 
 
623 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  35.1 
 
 
623 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  34.48 
 
 
623 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  33.23 
 
 
628 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  34.17 
 
 
620 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.33 
 
 
624 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  31.98 
 
 
619 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  31.98 
 
 
619 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  32.81 
 
 
624 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  33.12 
 
 
624 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  31.88 
 
 
619 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.84 
 
 
630 aa  284  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  29.95 
 
 
625 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  31.18 
 
 
638 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  28.48 
 
 
606 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  28.22 
 
 
610 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.32 
 
 
647 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  28.33 
 
 
606 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  27.54 
 
 
606 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  27.54 
 
 
606 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  27.67 
 
 
611 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  29.65 
 
 
621 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.5 
 
 
590 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  27.93 
 
 
592 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  29.62 
 
 
620 aa  180  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.17 
 
 
652 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  26.96 
 
 
590 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  29.08 
 
 
621 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  23.7 
 
 
609 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  26.68 
 
 
593 aa  167  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  27.36 
 
 
605 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  28.22 
 
 
597 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  27.19 
 
 
611 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  27.19 
 
 
611 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  27.03 
 
 
611 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  27.4 
 
 
612 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  26.88 
 
 
611 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  26.88 
 
 
611 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  26.88 
 
 
611 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  26.74 
 
 
588 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  27.07 
 
 
611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  25.62 
 
 
616 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  26.42 
 
 
589 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  27.24 
 
 
611 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  27.13 
 
 
589 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  26.81 
 
 
587 aa  145  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  27.11 
 
 
586 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  24.32 
 
 
611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  27.22 
 
 
597 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  25.86 
 
 
614 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  27.01 
 
 
597 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  25.66 
 
 
614 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  25.74 
 
 
614 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  24.81 
 
 
588 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  25.12 
 
 
612 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  25.12 
 
 
612 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  24.27 
 
 
607 aa  138  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  24.61 
 
 
588 aa  137  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  25.66 
 
 
610 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>