99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5778 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  61.52 
 
 
657 aa  823    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  89.69 
 
 
456 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  100 
 
 
662 aa  1347    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  38.85 
 
 
650 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  34.44 
 
 
659 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  34.44 
 
 
659 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  30.58 
 
 
659 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  29.01 
 
 
675 aa  219  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  29.36 
 
 
678 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0150  hypothetical protein  87.41 
 
 
135 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.865216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  27.04 
 
 
635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  28.18 
 
 
675 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  28.18 
 
 
675 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  33.73 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  27.16 
 
 
630 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  32.47 
 
 
721 aa  90.9  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  26.77 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 
556 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.19 
 
 
567 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.11 
 
 
555 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  25.56 
 
 
709 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  24.36 
 
 
480 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 
480 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  24.74 
 
 
551 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  26.29 
 
 
791 aa  60.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  23.7 
 
 
616 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.78 
 
 
497 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.78 
 
 
497 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.78 
 
 
497 aa  58.9  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.57 
 
 
617 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  26.05 
 
 
782 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 
617 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  30.36 
 
 
785 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  28.09 
 
 
774 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  24.04 
 
 
689 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
749 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  23.31 
 
 
581 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 
663 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  29.69 
 
 
649 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  26.29 
 
 
710 aa  54.7  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.48 
 
 
653 aa  54.3  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.8 
 
 
422 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.69 
 
 
704 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 
810 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 
541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 
541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 
541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 
541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  26.46 
 
 
572 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1241  hypothetical protein  67.65 
 
 
115 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 
509 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  26.46 
 
 
562 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  25.59 
 
 
539 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25.2 
 
 
677 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  27.16 
 
 
523 aa  52  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.2 
 
 
652 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.2 
 
 
652 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.2 
 
 
652 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  22.9 
 
 
738 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  22.9 
 
 
738 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.27 
 
 
560 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.1 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.99 
 
 
542 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  25.24 
 
 
497 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  22.93 
 
 
468 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.9 
 
 
640 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.7 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 
536 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  24.07 
 
 
634 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  23.58 
 
 
762 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  24.07 
 
 
634 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  21.76 
 
 
644 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  25.33 
 
 
740 aa  48.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  26.1 
 
 
611 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  26.41 
 
 
754 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.62 
 
 
651 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  28.57 
 
 
626 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  26.8 
 
 
614 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  24.49 
 
 
640 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  22.52 
 
 
829 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  24.06 
 
 
757 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.22 
 
 
558 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.35 
 
 
558 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  27.37 
 
 
560 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.41 
 
 
599 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.41 
 
 
599 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
382 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  24.8 
 
 
640 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  24.8 
 
 
640 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.63 
 
 
547 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  23.71 
 
 
718 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.52 
 
 
618 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  25.57 
 
 
561 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  25.26 
 
 
780 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  24.56 
 
 
801 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.51 
 
 
481 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>