More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2822 on replicon NC_009619
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  100 
 
 
480 aa  999    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  100 
 
 
480 aa  999    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  54.66 
 
 
481 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  53.42 
 
 
481 aa  519  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  45.56 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  45.56 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  45.56 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  42.82 
 
 
468 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 
581 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  29.77 
 
 
560 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  31.18 
 
 
567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  29.31 
 
 
558 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  29.53 
 
 
558 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  30.94 
 
 
555 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  28.54 
 
 
561 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  26.79 
 
 
547 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  32.03 
 
 
663 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  27.09 
 
 
625 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.57 
 
 
551 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  27.29 
 
 
614 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.4 
 
 
552 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.53 
 
 
626 aa  143  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.81 
 
 
618 aa  143  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.8 
 
 
541 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 
618 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  28.54 
 
 
618 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.8 
 
 
541 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.8 
 
 
541 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.8 
 
 
541 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  25.98 
 
 
614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  25.98 
 
 
614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.78 
 
 
630 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  25.98 
 
 
614 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25.33 
 
 
677 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.33 
 
 
652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.33 
 
 
652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.33 
 
 
652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.04 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.67 
 
 
616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  22.92 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  29.82 
 
 
677 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  24.6 
 
 
595 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  22.3 
 
 
611 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  22.74 
 
 
640 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.16 
 
 
548 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  23.8 
 
 
632 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  29.96 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.8 
 
 
640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  26.37 
 
 
617 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  25.68 
 
 
617 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  22.59 
 
 
640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  22.59 
 
 
640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 
536 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.76 
 
 
662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.76 
 
 
575 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.76 
 
 
662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  22.73 
 
 
509 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  22.73 
 
 
572 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  22.73 
 
 
562 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  21.54 
 
 
599 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  21.54 
 
 
599 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  22.57 
 
 
636 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  22.73 
 
 
560 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.44 
 
 
542 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  21.57 
 
 
422 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  21.58 
 
 
554 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  21.8 
 
 
649 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  22.79 
 
 
522 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  24.35 
 
 
665 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.07 
 
 
810 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  31.22 
 
 
245 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  28.51 
 
 
322 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 
636 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.92 
 
 
721 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  23.66 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  23.66 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  23.66 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  23.66 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
459 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
459 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  26.86 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  24.32 
 
 
902 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  27.59 
 
 
774 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  24.25 
 
 
733 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
905 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
905 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
905 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
905 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
905 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  26.86 
 
 
459 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  23.89 
 
 
782 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  22.06 
 
 
902 aa  90.1  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  21.63 
 
 
650 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  27.18 
 
 
724 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  23.17 
 
 
510 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  26.56 
 
 
907 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>