232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5456 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  100 
 
 		 547 aa  1093    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  57.59 
 
 		 552 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  41.85 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  41.85 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  41.85 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  41.85 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  37.52 
 
 		 625 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  38.25 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  39.2 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  38.17 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  38.17 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  38.17 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  38.17 
 
 		 541 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  35.7 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  39.66 
 
 		 547 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  37.67 
 
 		 630 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  34.97 
 
 		 626 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  37.01 
 
 		 640 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  34.3 
 
 		 616 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  38.59 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  38.59 
 
 		 562 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 509 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  33.95 
 
 		 595 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 618 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 618 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  38.35 
 
 		 560 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  36.63 
 
 		 554 aa  286  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  36.13 
 
 		 640 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  36.74 
 
 		 640 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  36.74 
 
 		 640 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  32.89 
 
 		 614 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  36.5 
 
 		 632 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  34.27 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  32.88 
 
 		 636 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  29.23 
 
 		 618 aa  259  7e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  40.39 
 
 		 422 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  36.07 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  36.07 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  34.35 
 
 		 542 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  45.32 
 
 		 497 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  42.38 
 
 		 382 aa  233  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  32.88 
 
 		 550 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  31.97 
 
 		 560 aa  186  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  31.1 
 
 		 649 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  33.43 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.49 
 
 		 558 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.68 
 
 		 558 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  33.43 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  33.43 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  28.02 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  29.48 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  30.23 
 
 		 561 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 560 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.79 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.79 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  27.91 
 
 		 581 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 		 614 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  34.56 
 
 		 468 aa  144  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  29.63 
 
 		 617 aa  143  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  29.32 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.73 
 
 		 677 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  28.73 
 
 		 652 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  28.73 
 
 		 652 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  28.73 
 
 		 652 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.77 
 
 		 567 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  30.15 
 
 		 663 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.64 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  31.33 
 
 		 704 aa  136  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  34 
 
 		 322 aa  134  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  29.2 
 
 		 810 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  29.04 
 
 		 670 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 653 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  27.78 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 905 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 905 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 905 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 905 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 905 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 662 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 662 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  32.74 
 
 		 733 aa  120  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  27.63 
 
 		 902 aa  120  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  29.22 
 
 		 626 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.34 
 
 		 900 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.34 
 
 		 900 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 721 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  32.78 
 
 		 724 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  24.35 
 
 		 636 aa  106  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  27.89 
 
 		 644 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  26.18 
 
 		 650 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  27.45 
 
 		 902 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  24.58 
 
 		 651 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  24.4 
 
 		 690 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  23.64 
 
 		 677 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  28.57 
 
 		 735 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  25.07 
 
 		 886 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.09 
 
 		 721 aa  94.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>