253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2267 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  100 
 
 		 626 aa  1304    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  28.29 
 
 		 670 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  31.25 
 
 		 677 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 652 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 652 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 652 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 662 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 662 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  26.36 
 
 		 575 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27.06 
 
 		 810 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.81 
 
 		 649 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.04 
 
 		 653 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  26.82 
 
 		 618 aa  124  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.59 
 
 		 650 aa  120  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  26.17 
 
 		 704 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  29.22 
 
 		 547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.67 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.67 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.67 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  25.38 
 
 		 617 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  29.05 
 
 		 551 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  29.14 
 
 		 721 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 618 aa  113  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 618 aa  113  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.85 
 
 		 617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 541 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  32.84 
 
 		 626 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  29.59 
 
 		 625 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  27.82 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  29.61 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.89 
 
 		 558 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.89 
 
 		 558 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.44 
 
 		 611 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  28.51 
 
 		 548 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.42 
 
 		 630 aa  97.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 547 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 497 aa  95.1  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 497 aa  95.1  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.76 
 
 		 497 aa  95.1  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  27.56 
 
 		 552 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 		 560 aa  94.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  24.42 
 
 		 554 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  28.67 
 
 		 497 aa  90.5  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.13 
 
 		 561 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  28.44 
 
 		 640 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  28.44 
 
 		 640 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.62 
 
 		 616 aa  87.8  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  28.53 
 
 		 640 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  23.35 
 
 		 902 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 382 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.18 
 
 		 536 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.36 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.36 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0016  hypothetical protein  25.94 
 
 		 662 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  23.84 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  23.48 
 
 		 917 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  23.33 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.95 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.54 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.54 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  24.54 
 
 		 801 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 		 636 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  21.7 
 
 		 791 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.52 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.52 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  23.48 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  23.68 
 
 		 902 aa  78.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 733 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  24.05 
 
 		 782 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2269  hypothetical protein  52.05 
 
 		 83 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0646523 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  25.11 
 
 		 481 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  28.44 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25.21 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  27.76 
 
 		 640 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  24.64 
 
 		 710 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  27.76 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  25.93 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.84 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  25.19 
 
 		 754 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 782 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  22.48 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.2 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  40.22 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  22.7 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  28.78 
 
 		 749 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  20.84 
 
 		 886 aa  66.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>