139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0193 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  43.76 
 
 
886 aa  795    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  47.11 
 
 
907 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  100 
 
 
905 aa  1892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  100 
 
 
905 aa  1892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  100 
 
 
905 aa  1892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  100 
 
 
905 aa  1892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  100 
 
 
905 aa  1892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  43.16 
 
 
917 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  39.93 
 
 
922 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  32.8 
 
 
902 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  31.22 
 
 
902 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  31.6 
 
 
900 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  31.6 
 
 
900 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  29.72 
 
 
947 aa  339  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
976 aa  337  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
1010 aa  337  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  29.26 
 
 
960 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  27.6 
 
 
876 aa  298  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  27.91 
 
 
904 aa  287  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  26.29 
 
 
618 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  25.78 
 
 
625 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  27.13 
 
 
794 aa  137  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  27.12 
 
 
640 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  26.6 
 
 
640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  26.6 
 
 
640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 
541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 
541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 
541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.96 
 
 
541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  28.54 
 
 
548 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.7 
 
 
547 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  29.41 
 
 
640 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  29.14 
 
 
632 aa  114  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  26.11 
 
 
626 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  29.33 
 
 
547 aa  111  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 
556 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 
556 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 
556 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 
556 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.67 
 
 
552 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.23 
 
 
630 aa  104  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.17 
 
 
611 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 
614 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  31.85 
 
 
497 aa  99  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.32 
 
 
572 aa  99  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.32 
 
 
562 aa  98.6  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 
509 aa  98.2  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 
536 aa  97.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  23.45 
 
 
560 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.75 
 
 
616 aa  95.1  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 
636 aa  94.4  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 
551 aa  93.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  23.31 
 
 
595 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
480 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  27.4 
 
 
480 aa  90.5  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 
560 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  23.5 
 
 
554 aa  88.2  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  27.15 
 
 
733 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
662 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
662 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  28.32 
 
 
561 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.44 
 
 
575 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  23.98 
 
 
422 aa  86.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 
599 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.61 
 
 
617 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  24.32 
 
 
626 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.36 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.86 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  23.98 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.23 
 
 
670 aa  81.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  22.96 
 
 
382 aa  80.5  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  29.8 
 
 
300 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.79 
 
 
636 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  25.92 
 
 
550 aa  78.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.09 
 
 
542 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  22.83 
 
 
652 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  22.83 
 
 
652 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  22.83 
 
 
652 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  20.92 
 
 
677 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.67 
 
 
567 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.78 
 
 
555 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  23.54 
 
 
649 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  28.16 
 
 
721 aa  75.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.46 
 
 
650 aa  74.7  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.33 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.33 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.33 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  28.82 
 
 
581 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  29.68 
 
 
785 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  27.35 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  23.51 
 
 
754 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  22.1 
 
 
710 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 
782 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  26.29 
 
 
560 aa  65.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  21.29 
 
 
481 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  25 
 
 
644 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>