More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6241 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 536 aa  1097    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  52.49 
 
 		 542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  55.3 
 
 		 599 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  55.3 
 
 		 599 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  39.59 
 
 		 548 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  38.79 
 
 		 551 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  36.04 
 
 		 541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  33.73 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  39.39 
 
 		 572 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  39.39 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  33.02 
 
 		 625 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  37.94 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  39.48 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  32.59 
 
 		 611 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  35.95 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  34.28 
 
 		 630 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  36.61 
 
 		 554 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  34.69 
 
 		 547 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 614 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  35.5 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  41.78 
 
 		 382 aa  240  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  40.45 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  30.18 
 
 		 616 aa  230  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  28.99 
 
 		 636 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  31.84 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  31.46 
 
 		 595 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  27.81 
 
 		 618 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  31.84 
 
 		 632 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  29.62 
 
 		 640 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  28.85 
 
 		 640 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  28.85 
 
 		 640 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  40 
 
 		 497 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.87 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.87 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  31.59 
 
 		 550 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  30.54 
 
 		 560 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6246  hypothetical protein  62.99 
 
 		 353 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  31.25 
 
 		 558 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  31.25 
 
 		 558 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  34.29 
 
 		 291 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 649 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.62 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  32.81 
 
 		 322 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  37.84 
 
 		 677 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  30.06 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  37.84 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  37.84 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  37.84 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 		 663 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  28.1 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.22 
 
 		 555 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.06 
 
 		 567 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.55 
 
 		 617 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  27.62 
 
 		 617 aa  111  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  30.5 
 
 		 810 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  29.15 
 
 		 468 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  28.79 
 
 		 733 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  30.62 
 
 		 728 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  27.27 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  28.36 
 
 		 900 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  28.36 
 
 		 900 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  28.37 
 
 		 902 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  28.06 
 
 		 902 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.78 
 
 		 653 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 905 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 905 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 905 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 905 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.67 
 
 		 905 aa  97.4  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  27.68 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  27.05 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  28.41 
 
 		 740 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4687  integrase, catalytic region  38.93 
 
 		 168 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.887528  normal  0.0224693 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  28.03 
 
 		 704 aa  94.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  28.21 
 
 		 497 aa  94.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  28.21 
 
 		 497 aa  94.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  28.21 
 
 		 497 aa  94.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  24.31 
 
 		 774 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26.59 
 
 		 481 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  30.65 
 
 		 644 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.65 
 
 		 886 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  27.25 
 
 		 670 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  26.79 
 
 		 696 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  28.51 
 
 		 721 aa  90.9  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  26.04 
 
 		 907 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  23.71 
 
 		 917 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  24.35 
 
 		 636 aa  87  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  27.18 
 
 		 626 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  32.62 
 
 		 730 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 782 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>