204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2981 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  86.49 
 
 
555 aa  996    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  67.75 
 
 
581 aa  787    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  100 
 
 
567 aa  1176    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  54.43 
 
 
561 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  52.6 
 
 
558 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  52.22 
 
 
558 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  52.05 
 
 
560 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  42.78 
 
 
663 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  41.65 
 
 
614 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  41.65 
 
 
614 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  41.65 
 
 
614 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  35.37 
 
 
677 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2225  integrase catalytic subunit  53.52 
 
 
251 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 
245 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  31.18 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  31.18 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  32.43 
 
 
497 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  32.43 
 
 
497 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  32.43 
 
 
497 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  27.85 
 
 
618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  32.14 
 
 
481 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  32.4 
 
 
481 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  28.96 
 
 
625 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 
468 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  28.63 
 
 
618 aa  148  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  28.63 
 
 
618 aa  148  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.18 
 
 
616 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  28.44 
 
 
652 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  28.44 
 
 
652 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 
652 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.44 
 
 
677 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  32.5 
 
 
617 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  32.19 
 
 
617 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  28.16 
 
 
552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.02 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  26.13 
 
 
630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2185  transposase  37.37 
 
 
224 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  27.51 
 
 
599 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  27.51 
 
 
599 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25.09 
 
 
536 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.68 
 
 
556 aa  124  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 
614 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.68 
 
 
556 aa  124  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.68 
 
 
556 aa  124  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.68 
 
 
556 aa  124  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.56 
 
 
548 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  25.46 
 
 
595 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  31.38 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.15 
 
 
636 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.72 
 
 
626 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.5 
 
 
541 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.5 
 
 
541 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.5 
 
 
541 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.5 
 
 
541 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.94 
 
 
653 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  26.49 
 
 
560 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.89 
 
 
542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
382 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.74 
 
 
611 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  29.27 
 
 
810 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  24.22 
 
 
551 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  26.24 
 
 
554 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  31.9 
 
 
650 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  25.55 
 
 
640 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.8 
 
 
547 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 
715 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 
715 aa  101  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.21 
 
 
640 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.16 
 
 
632 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  31.29 
 
 
509 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  31.29 
 
 
572 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  31.29 
 
 
562 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  26.14 
 
 
644 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  29.33 
 
 
497 aa  95.9  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  30.88 
 
 
560 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  23.97 
 
 
640 aa  93.6  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  23.97 
 
 
640 aa  93.6  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 
636 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  22.84 
 
 
886 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 
662 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  29.08 
 
 
662 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  29.08 
 
 
575 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.23 
 
 
721 aa  87.4  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  24.65 
 
 
907 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  33.53 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  29.15 
 
 
733 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  24.43 
 
 
749 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 
782 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  23.46 
 
 
757 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  24.93 
 
 
697 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  24.83 
 
 
634 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  24.83 
 
 
634 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  27.86 
 
 
791 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 
905 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 
905 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 
905 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 
905 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 
905 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  26.5 
 
 
762 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>