172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3039 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 614 aa  1272    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  34.56 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  33.22 
 
 		 625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  34.77 
 
 		 560 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  35.35 
 
 		 548 aa  273  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 		 541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 		 541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 		 541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  33.73 
 
 		 541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  33.78 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  34.58 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  36.21 
 
 		 509 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  33.4 
 
 		 547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  32.69 
 
 		 630 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  29.54 
 
 		 616 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  30.04 
 
 		 626 aa  243  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  32.18 
 
 		 611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  33.19 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  35.45 
 
 		 422 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 599 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  30.07 
 
 		 640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  32.24 
 
 		 554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  29.23 
 
 		 640 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  30.49 
 
 		 595 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 618 aa  230  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 618 aa  230  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  29.39 
 
 		 632 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  35.8 
 
 		 542 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  32.81 
 
 		 547 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  30.75 
 
 		 640 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  30.75 
 
 		 640 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  30.43 
 
 		 636 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 		 382 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  29.64 
 
 		 618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  35.81 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 		 550 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  28.06 
 
 		 560 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  33.01 
 
 		 617 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.43 
 
 		 677 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  29.59 
 
 		 652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  29.59 
 
 		 652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  29.59 
 
 		 652 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  32.48 
 
 		 617 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  34.47 
 
 		 649 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.83 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.83 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  26.25 
 
 		 560 aa  137  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.86 
 
 		 653 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  29.8 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  29.38 
 
 		 567 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  26.37 
 
 		 558 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.68 
 
 		 555 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  26.37 
 
 		 558 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  30.45 
 
 		 670 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.93 
 
 		 733 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  26.21 
 
 		 902 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  27.15 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  27.15 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  27.15 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  28.98 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  28.78 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  25.15 
 
 		 907 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  27.72 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  29.71 
 
 		 810 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  30.15 
 
 		 322 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 905 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 905 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 905 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 905 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 905 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.61 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  23.73 
 
 		 886 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  25.63 
 
 		 960 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.65 
 
 		 721 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.66 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 900 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.92 
 
 		 900 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  25.21 
 
 		 922 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  23 
 
 		 902 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.66 
 
 		 704 aa  96.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 636 aa  96.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  25.97 
 
 		 575 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 662 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 662 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  23.79 
 
 		 626 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  25.12 
 
 		 677 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  28.99 
 
 		 785 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  26.75 
 
 		 782 aa  90.5  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  27.07 
 
 		 876 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  25.88 
 
 		 730 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>