165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0187 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  100 
 
 		 611 aa  1256    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  47.29 
 
 		 625 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  42.81 
 
 		 626 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  43.8 
 
 		 630 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  39.79 
 
 		 595 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  42.5 
 
 		 616 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  42.13 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  39.64 
 
 		 640 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  42.29 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  39.82 
 
 		 632 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  42.29 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  38.4 
 
 		 618 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  38.4 
 
 		 618 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  39.5 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  39.5 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  39.5 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  39.5 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  37.78 
 
 		 636 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  37.15 
 
 		 551 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  37.23 
 
 		 554 aa  323  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  36.4 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  36.4 
 
 		 562 aa  320  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  36.01 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  39.3 
 
 		 509 aa  316  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  34.3 
 
 		 548 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  35.83 
 
 		 547 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  34.92 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  34.92 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  34.92 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  34.92 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  32.53 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  33.01 
 
 		 542 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  32.37 
 
 		 536 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  34 
 
 		 552 aa  266  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  36.41 
 
 		 422 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  33.02 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  43.96 
 
 		 291 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  38.84 
 
 		 382 aa  247  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  31.78 
 
 		 614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  41.5 
 
 		 322 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  35.81 
 
 		 497 aa  198  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 560 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  26.42 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  26.24 
 
 		 558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.99 
 
 		 649 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.23 
 
 		 617 aa  136  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 617 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.63 
 
 		 481 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.67 
 
 		 481 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  27.31 
 
 		 670 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.15 
 
 		 561 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.38 
 
 		 733 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.44 
 
 		 721 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  28.86 
 
 		 652 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  28.86 
 
 		 652 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  28.86 
 
 		 652 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.5 
 
 		 677 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  25.17 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 663 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  26.33 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.06 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.06 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  26.51 
 
 		 560 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.04 
 
 		 497 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.04 
 
 		 497 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.04 
 
 		 497 aa  114  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.4 
 
 		 650 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.24 
 
 		 581 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  24.52 
 
 		 636 aa  110  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.21 
 
 		 653 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 810 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  23.58 
 
 		 886 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  25.97 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  25.59 
 
 		 902 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 		 905 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 		 905 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 		 905 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 		 905 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 		 905 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  25.71 
 
 		 902 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.4 
 
 		 900 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.4 
 
 		 900 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  22.7 
 
 		 704 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  23.34 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  23.34 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  23.34 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  31.51 
 
 		 785 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  25.65 
 
 		 907 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 626 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 614 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 614 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  23.63 
 
 		 614 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 		 782 aa  94  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  26.47 
 
 		 774 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  21.44 
 
 		 651 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  25.82 
 
 		 710 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  25.59 
 
 		 922 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>