124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1983 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  43.76 
 
 
905 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  43.76 
 
 
905 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  43.76 
 
 
905 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  43.76 
 
 
905 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  43.76 
 
 
905 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  44.75 
 
 
917 aa  757    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  46.33 
 
 
907 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  100 
 
 
886 aa  1831    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  39.06 
 
 
922 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  32.67 
 
 
902 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  32.31 
 
 
900 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  32.31 
 
 
900 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  30.45 
 
 
902 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  30.41 
 
 
947 aa  356  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 
976 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 
1010 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  28.52 
 
 
960 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  26.91 
 
 
904 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  26.44 
 
 
876 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.48 
 
 
618 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  25.48 
 
 
794 aa  140  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  25.17 
 
 
625 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  23.83 
 
 
640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  22.69 
 
 
640 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  22.89 
 
 
632 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  24.69 
 
 
548 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  23.41 
 
 
640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  23.41 
 
 
640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  23.56 
 
 
616 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
618 aa  119  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
618 aa  119  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  26.13 
 
 
630 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 
547 aa  109  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25.46 
 
 
626 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 
556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 
556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 
556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 
556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.58 
 
 
611 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 
541 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 
541 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 
541 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 
541 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  23.73 
 
 
614 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  23.53 
 
 
554 aa  102  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  21.02 
 
 
595 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  23.8 
 
 
636 aa  95.1  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.07 
 
 
547 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  25.51 
 
 
382 aa  94  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.58 
 
 
552 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  24.65 
 
 
536 aa  92  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
551 aa  90.1  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  23.01 
 
 
662 aa  88.6  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  23.01 
 
 
662 aa  88.6  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  22.77 
 
 
575 aa  88.2  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
652 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.98 
 
 
652 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.98 
 
 
652 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.98 
 
 
677 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  26.56 
 
 
322 aa  87  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  22.88 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  23.08 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  22.41 
 
 
422 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  22.49 
 
 
560 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  22.13 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  22.13 
 
 
572 aa  81.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  22.13 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  22.38 
 
 
581 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.9 
 
 
721 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.06 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.22 
 
 
649 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  32.52 
 
 
497 aa  80.1  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  22.52 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  24.92 
 
 
785 aa  79  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  24.72 
 
 
733 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  27.94 
 
 
550 aa  77  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  21.29 
 
 
555 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.03 
 
 
644 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  24.48 
 
 
599 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  24.48 
 
 
599 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.83 
 
 
653 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.58 
 
 
636 aa  72.8  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.44 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.44 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  22.2 
 
 
670 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.69 
 
 
617 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 
468 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  26.37 
 
 
300 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 
617 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.78 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.78 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  21.86 
 
 
481 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  26.53 
 
 
663 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  29.17 
 
 
561 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.19 
 
 
481 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  20.84 
 
 
626 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  22.8 
 
 
497 aa  65.1  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  22.8 
 
 
497 aa  65.1  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  22.8 
 
 
497 aa  65.1  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  20.31 
 
 
715 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>