171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0377 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 636 aa  1316    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  31.55 
 
 		 617 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  30.07 
 
 		 617 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  28.73 
 
 		 650 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.96 
 
 		 662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.96 
 
 		 662 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  25.04 
 
 		 575 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  28.16 
 
 		 618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  28.16 
 
 		 618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 618 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.21 
 
 		 677 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.21 
 
 		 652 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.21 
 
 		 652 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.21 
 
 		 652 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  26.79 
 
 		 626 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  23.93 
 
 		 649 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  27.17 
 
 		 653 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.03 
 
 		 630 aa  137  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 810 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  29.1 
 
 		 721 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  28.17 
 
 		 733 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  28.53 
 
 		 552 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  23.73 
 
 		 636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  26.16 
 
 		 554 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  24.19 
 
 		 560 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.73 
 
 		 625 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  24.8 
 
 		 595 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  22.45 
 
 		 616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.53 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.53 
 
 		 509 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.53 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.59 
 
 		 548 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.18 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.18 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  25.13 
 
 		 422 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  24.4 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.14 
 
 		 547 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  22.95 
 
 		 670 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 		 663 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 782 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  24.8 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  28.53 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.64 
 
 		 651 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  21.55 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.11 
 
 		 547 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.34 
 
 		 558 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.34 
 
 		 558 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  24.36 
 
 		 716 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  23.21 
 
 		 754 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25.67 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 		 905 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 		 905 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 		 905 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 		 905 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  25.31 
 
 		 905 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.72 
 
 		 542 aa  98.2  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 900 aa  97.8  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 900 aa  97.8  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.33 
 
 		 581 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  28.08 
 
 		 567 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  27.33 
 
 		 333 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  27.21 
 
 		 560 aa  94.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  26.52 
 
 		 551 aa  94.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  21.74 
 
 		 632 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 560 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  32.66 
 
 		 677 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  23.43 
 
 		 902 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  28.73 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  28.73 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  28.73 
 
 		 614 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.87 
 
 		 561 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.56 
 
 		 468 aa  91.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.65 
 
 		 447 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25.87 
 
 		 481 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  24.74 
 
 		 644 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  24.35 
 
 		 536 aa  90.5  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 907 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  25.58 
 
 		 481 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  30.97 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  30.97 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  30.97 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  20.38 
 
 		 640 aa  87.4  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  26.64 
 
 		 497 aa  87  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  28.91 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  26.69 
 
 		 697 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  29.5 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.9 
 
 		 721 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  23.33 
 
 		 626 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  21.96 
 
 		 640 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  21.96 
 
 		 640 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>