173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2235 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  100 
 
 		 644 aa  1350    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  29.84 
 
 		 487 aa  200  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.22 
 
 		 653 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 617 aa  124  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.48 
 
 		 677 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 652 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 652 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.48 
 
 		 652 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.17 
 
 		 617 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.3 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  30.47 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  30.08 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  30.08 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.72 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.89 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.46 
 
 		 618 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  26.27 
 
 		 560 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  27.54 
 
 		 640 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  24.2 
 
 		 618 aa  98.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  24.2 
 
 		 618 aa  98.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  26.76 
 
 		 640 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  26.76 
 
 		 640 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 		 810 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  25.48 
 
 		 554 aa  97.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.33 
 
 		 595 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.8 
 
 		 581 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.14 
 
 		 567 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.61 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.61 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.61 
 
 		 556 aa  96.3  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.61 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25.66 
 
 		 626 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.98 
 
 		 548 aa  94.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  30.65 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  23.9 
 
 		 575 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  23.9 
 
 		 662 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  22.95 
 
 		 670 aa  93.6  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  24.71 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  23.69 
 
 		 650 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  22.78 
 
 		 547 aa  91.3  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  23.68 
 
 		 599 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  23.68 
 
 		 599 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  25.67 
 
 		 632 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 		 663 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  25.67 
 
 		 640 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  26.52 
 
 		 630 aa  89  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  31.4 
 
 		 723 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  21.96 
 
 		 611 aa  87.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  24.35 
 
 		 422 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.97 
 
 		 636 aa  85.9  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  27.46 
 
 		 754 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  23.68 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.13 
 
 		 542 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  27.56 
 
 		 728 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  26.25 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  28.64 
 
 		 625 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.36 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 541 aa  81.6  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25.17 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  22.82 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  22.82 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  22.82 
 
 		 562 aa  80.5  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  29.9 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  29.9 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  29.9 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  25.8 
 
 		 710 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 614 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.73 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.73 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  23.62 
 
 		 743 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  23.03 
 
 		 886 aa  77  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  24.59 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2177  integrase catalytic region  23.41 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.68768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  26.97 
 
 		 762 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2185  transposase  24.88 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  25.42 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  26.5 
 
 		 730 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  23.01 
 
 		 651 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  23.35 
 
 		 922 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  25.58 
 
 		 735 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  23.68 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  21.07 
 
 		 721 aa  72.4  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  27.51 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.1 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.1 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.1 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  22.67 
 
 		 733 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  26.45 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  24.04 
 
 		 690 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  28.12 
 
 		 722 aa  67.8  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  32.12 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  28.92 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  22.74 
 
 		 774 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  22.53 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  23.08 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  27.72 
 
 		 697 aa  63.9  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>