139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06969 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1016    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  29.84 
 
 		 644 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  27.4 
 
 		 754 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.79 
 
 		 677 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.79 
 
 		 652 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.79 
 
 		 652 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.79 
 
 		 652 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.71 
 
 		 649 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  26.55 
 
 		 704 aa  87.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  28.78 
 
 		 710 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.47 
 
 		 617 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  27.96 
 
 		 653 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  22.61 
 
 		 618 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  33.54 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  30.6 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  28.18 
 
 		 733 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  23.56 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  28.67 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  28.67 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  22.57 
 
 		 762 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.94 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  21.55 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  29.03 
 
 		 718 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  26.44 
 
 		 780 aa  70.5  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  21.55 
 
 		 662 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  21.55 
 
 		 662 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2177  integrase catalytic region  23.92 
 
 		 671 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.68768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  24.23 
 
 		 749 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.98 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  25.21 
 
 		 876 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  29.78 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  25.3 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25.5 
 
 		 536 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.71 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.71 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.94 
 
 		 670 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.83 
 
 		 630 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  21.48 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  25.46 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  27.47 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.79 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.79 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.79 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  27.84 
 
 		 774 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.96 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 		 905 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 		 905 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 		 905 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 		 905 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  24.63 
 
 		 905 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.84 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.67 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  23.57 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  30.95 
 
 		 690 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.04 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.5 
 
 		 626 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  24.5 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  25.13 
 
 		 625 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  31.13 
 
 		 697 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  24.18 
 
 		 782 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  28.99 
 
 		 782 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  25.14 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  25.14 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.5 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.19 
 
 		 810 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  26.45 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  27.95 
 
 		 677 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.81 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.83 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  24.51 
 
 		 636 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.98 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  27.91 
 
 		 684 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.98 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  25.34 
 
 		 523 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  24.09 
 
 		 749 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  24.87 
 
 		 696 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  26.79 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.55 
 
 		 616 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  27.34 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  22.45 
 
 		 738 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  22.45 
 
 		 738 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  30.6 
 
 		 728 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 636 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  25.07 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.4 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.4 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.4 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 		 551 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 		 614 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>