115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3487 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  100 
 
 		 742 aa  1527    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  49.86 
 
 		 721 aa  693    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  64.3 
 
 		 743 aa  998    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  64.48 
 
 		 690 aa  950    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  41.3 
 
 		 722 aa  555  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  40.83 
 
 		 716 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  41.5 
 
 		 730 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  40.89 
 
 		 721 aa  529  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  40.89 
 
 		 721 aa  529  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  40.74 
 
 		 728 aa  515  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  50.11 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 696 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  33.23 
 
 		 735 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  34.75 
 
 		 696 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 717 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  32.98 
 
 		 672 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  33.33 
 
 		 697 aa  333  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  34.03 
 
 		 690 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  31.67 
 
 		 723 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  30.89 
 
 		 728 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  29.91 
 
 		 723 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  32.43 
 
 		 725 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  43.63 
 
 		 258 aa  206  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  27.61 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  26.7 
 
 		 735 aa  179  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  34.19 
 
 		 806 aa  172  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  27.16 
 
 		 748 aa  142  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.6 
 
 		 547 aa  90.9  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  26.37 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.9 
 
 		 616 aa  83.2  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.86 
 
 		 618 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.86 
 
 		 618 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  24.23 
 
 		 724 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.42 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.32 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.4 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.4 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.33 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  26.34 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.82 
 
 		 548 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.68 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.74 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.5 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  25.4 
 
 		 554 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.59 
 
 		 721 aa  69.7  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  27.98 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  27.98 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  27.98 
 
 		 562 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  22.6 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.65 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  24.13 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  24.13 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25.95 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  23.57 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  23.81 
 
 		 640 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  28.07 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.8 
 
 		 599 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.8 
 
 		 599 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.5 
 
 		 555 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.16 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  21.77 
 
 		 617 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  26.16 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  26.16 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  26.16 
 
 		 652 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.63 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.08 
 
 		 617 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.37 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  23.83 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  23.72 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.41 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.32 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  23.29 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  28.19 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  24.21 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  23.08 
 
 		 670 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  23.66 
 
 		 636 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.63 
 
 		 651 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  22.25 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  22.25 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  22.25 
 
 		 614 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.1 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 		 560 aa  54.3  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  21.13 
 
 		 547 aa  54.3  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 653 aa  54.3  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.02 
 
 		 480 aa  53.9  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.02 
 
 		 480 aa  53.9  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 630 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  32.95 
 
 		 497 aa  52  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  34.83 
 
 		 322 aa  51.2  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  43.1 
 
 		 245 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  23.26 
 
 		 614 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  26.89 
 
 		 785 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  26.47 
 
 		 907 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  29.2 
 
 		 905 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>