108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7026 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  100 
 
 		 735 aa  1515    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  42.54 
 
 		 723 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  38.22 
 
 		 723 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  36.19 
 
 		 730 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  34.3 
 
 		 743 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  33.38 
 
 		 690 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  35.1 
 
 		 721 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  36.68 
 
 		 728 aa  397  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  33.19 
 
 		 716 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  33.23 
 
 		 742 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  35.65 
 
 		 721 aa  376  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  35.65 
 
 		 721 aa  376  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  34.39 
 
 		 722 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  32.84 
 
 		 696 aa  324  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  39.65 
 
 		 447 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  31.01 
 
 		 717 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  34.17 
 
 		 690 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  35.4 
 
 		 697 aa  281  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  32.34 
 
 		 696 aa  279  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  31.84 
 
 		 672 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  34.56 
 
 		 728 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  33.33 
 
 		 725 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  31.19 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  27.05 
 
 		 735 aa  183  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  32.29 
 
 		 806 aa  157  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  26.56 
 
 		 748 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.55 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  23.79 
 
 		 670 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  29.15 
 
 		 625 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  24.5 
 
 		 724 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.2 
 
 		 548 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  28.12 
 
 		 258 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  28.19 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  26.28 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.46 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  24.17 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.93 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.93 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.93 
 
 		 677 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.31 
 
 		 721 aa  77  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.95 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  25.77 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  23.19 
 
 		 536 aa  73.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  25.09 
 
 		 547 aa  73.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 551 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  25.58 
 
 		 644 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.56 
 
 		 630 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  22.32 
 
 		 614 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.16 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.16 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  24.48 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  24.48 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.48 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  24.48 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.83 
 
 		 542 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.82 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  24.43 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.45 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.83 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.35 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.7 
 
 		 567 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  25.94 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.53 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.03 
 
 		 640 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.02 
 
 		 581 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  19.71 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  23.67 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  26.18 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.15 
 
 		 558 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.15 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.58 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  24.07 
 
 		 782 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  23.46 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.48 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  23.51 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  22.25 
 
 		 640 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  22.25 
 
 		 640 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  22.25 
 
 		 640 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.33 
 
 		 480 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.33 
 
 		 480 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.58 
 
 		 663 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.92 
 
 		 497 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.92 
 
 		 497 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.92 
 
 		 497 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 		 550 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>