137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0729 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0729  transposase, putative  100 
 
 		 704 aa  1438    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  34.51 
 
 		 710 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  26.97 
 
 		 754 aa  248  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  29.63 
 
 		 740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  27.38 
 
 		 749 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 782 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  26.77 
 
 		 762 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  27.08 
 
 		 774 aa  193  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  30.23 
 
 		 780 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  28.71 
 
 		 810 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  31.99 
 
 		 572 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  31.99 
 
 		 562 aa  146  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  31.18 
 
 		 560 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 652 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  28.33 
 
 		 652 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  28.33 
 
 		 652 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.33 
 
 		 677 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  30.99 
 
 		 422 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  31.3 
 
 		 547 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0721  integrase catalytic subunit  86.67 
 
 		 95 aa  127  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  26.78 
 
 		 640 aa  124  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25.65 
 
 		 626 aa  124  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  29.72 
 
 		 551 aa  120  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  27.97 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  27.97 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  24.13 
 
 		 617 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  26.17 
 
 		 626 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 		 556 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 		 556 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  27.25 
 
 		 556 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  24.35 
 
 		 617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  27.48 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.3 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.86 
 
 		 640 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  26.26 
 
 		 632 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  27.93 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.34 
 
 		 625 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.88 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  27.48 
 
 		 548 aa  107  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 630 aa  107  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  28.8 
 
 		 542 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  28.02 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  22.73 
 
 		 618 aa  101  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  22.81 
 
 		 618 aa  100  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  22.81 
 
 		 618 aa  100  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.66 
 
 		 616 aa  99.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.59 
 
 		 611 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.98 
 
 		 595 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.66 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  27.01 
 
 		 382 aa  95.9  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 536 aa  94.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25 
 
 		 653 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  24.71 
 
 		 644 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 670 aa  91.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.1 
 
 		 733 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.16 
 
 		 599 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.16 
 
 		 599 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  23.57 
 
 		 721 aa  87.8  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  27.3 
 
 		 497 aa  84.7  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  25.68 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  25.93 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.46 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.46 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.46 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  24.82 
 
 		 651 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 782 aa  77.4  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  23.7 
 
 		 636 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  28.63 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  25.82 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.68 
 
 		 560 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.03 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.03 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.78 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  24.04 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.29 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  23.08 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  26.61 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.73 
 
 		 561 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.49 
 
 		 558 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.13 
 
 		 636 aa  67  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.49 
 
 		 558 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  21.59 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  23.33 
 
 		 917 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  24.59 
 
 		 902 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  28.64 
 
 		 709 aa  63.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  23.3 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  28.08 
 
 		 657 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>