137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5056 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  99.83 
 
 
662 aa  1182    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  99.83 
 
 
662 aa  1182    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  100 
 
 
575 aa  1182    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  31.36 
 
 
617 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  31.55 
 
 
617 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  28.7 
 
 
650 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  28.7 
 
 
652 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  28.7 
 
 
652 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  28.7 
 
 
652 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.7 
 
 
677 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  27.02 
 
 
653 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.71 
 
 
649 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.28 
 
 
636 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  26.36 
 
 
626 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.95 
 
 
721 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  25.13 
 
 
625 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.95 
 
 
810 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  28.88 
 
 
782 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.65 
 
 
595 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.78 
 
 
547 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  25.06 
 
 
733 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  25 
 
 
640 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24.11 
 
 
618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
618 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
618 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25.53 
 
 
626 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 
541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  25 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  25 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  29.31 
 
 
552 aa  113  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  24.85 
 
 
548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  24.94 
 
 
640 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  25.38 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  26.1 
 
 
630 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.85 
 
 
670 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  24 
 
 
704 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  30.13 
 
 
556 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  30.13 
 
 
556 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  30.13 
 
 
556 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  30.13 
 
 
556 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.61 
 
 
611 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  29.14 
 
 
551 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  24.76 
 
 
480 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  24.76 
 
 
480 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  23.6 
 
 
616 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  23.35 
 
 
754 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  35.33 
 
 
497 aa  94.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.07 
 
 
636 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.9 
 
 
644 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 
614 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  26.5 
 
 
333 aa  91.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  24.4 
 
 
902 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  23.81 
 
 
560 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 
468 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  29.08 
 
 
567 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  22.77 
 
 
886 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  23.72 
 
 
481 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  28.9 
 
 
422 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
905 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
905 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
905 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
905 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 
905 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  25.33 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  25.17 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  23.71 
 
 
740 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  23.32 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  23.32 
 
 
572 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  23.32 
 
 
562 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  27.2 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  27.86 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  27.86 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  27.86 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  26.76 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  27.31 
 
 
555 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 
560 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  22.43 
 
 
900 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  22.43 
 
 
900 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  25.6 
 
 
749 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  23.43 
 
 
710 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  24.19 
 
 
782 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  24.92 
 
 
550 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  24.16 
 
 
774 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  24.91 
 
 
922 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  23.94 
 
 
651 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  22.16 
 
 
785 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  24.86 
 
 
560 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.1 
 
 
558 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.1 
 
 
558 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.23 
 
 
561 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  26.29 
 
 
902 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  25.51 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  25.51 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  25.51 
 
 
614 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 
663 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  21.55 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>