132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5797 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5797  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 245 aa  500  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  53.71 
 
 		 558 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  53.28 
 
 		 558 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  53.91 
 
 		 561 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  48.95 
 
 		 560 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  49.78 
 
 		 567 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  48.43 
 
 		 555 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  48.02 
 
 		 581 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2225  integrase catalytic subunit  49.51 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 663 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  39.58 
 
 		 614 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  39.58 
 
 		 614 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  39.58 
 
 		 614 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  32.22 
 
 		 677 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  31.22 
 
 		 480 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  31.22 
 
 		 480 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  32.64 
 
 		 497 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  32.64 
 
 		 497 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  32.64 
 
 		 497 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  30.35 
 
 		 481 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  29.85 
 
 		 481 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2185  transposase  44.93 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  35 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  33 
 
 		 468 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  30.22 
 
 		 630 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  27.4 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  52.38 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  29.88 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  44.87 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 556 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 556 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  40.46 
 
 		 556 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 556 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  27.76 
 
 		 611 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  30.6 
 
 		 625 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  26.1 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  26.1 
 
 		 618 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 599 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  28.3 
 
 		 599 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  50 
 
 		 595 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  43.59 
 
 		 542 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  28.09 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  28.09 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 614 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  33.33 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  32.12 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  26.05 
 
 		 636 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  27.84 
 
 		 632 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  27.32 
 
 		 640 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  32.82 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  32.82 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  31 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  26.63 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  26.63 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  26.58 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  30.87 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 536 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  41.43 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  41.43 
 
 		 652 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  41.43 
 
 		 677 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  28.64 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  41.94 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  42.25 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  32.39 
 
 		 653 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  38.71 
 
 		 617 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  31.09 
 
 		 733 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  46.97 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  25.45 
 
 		 902 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  41.67 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  41.67 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  36.99 
 
 		 650 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  38.67 
 
 		 902 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  33.78 
 
 		 907 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  39.73 
 
 		 722 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  41.43 
 
 		 876 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  42.37 
 
 		 721 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  39.73 
 
 		 721 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  39.73 
 
 		 721 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  43.02 
 
 		 560 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  35.59 
 
 		 662 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  35.59 
 
 		 662 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  43.33 
 
 		 447 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  35.59 
 
 		 575 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 		 905 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 		 905 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 		 905 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 		 905 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  43.1 
 
 		 742 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  46.3 
 
 		 905 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  36.11 
 
 		 728 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  24.75 
 
 		 715 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>