258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5462 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5462  transposase  100 
 
 		 552 aa  1100    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  60.25 
 
 		 547 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  40.19 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  41.36 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  41.36 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  41.36 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  41.36 
 
 		 556 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  34.96 
 
 		 625 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  38.81 
 
 		 551 aa  327  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  36.59 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  39.73 
 
 		 547 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  38.3 
 
 		 630 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 		 541 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 		 541 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 		 541 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 		 541 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  33.94 
 
 		 595 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  34 
 
 		 611 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  38.82 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  36.14 
 
 		 640 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  36.42 
 
 		 640 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  37.45 
 
 		 562 aa  273  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  37.45 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  36.82 
 
 		 560 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  29.37 
 
 		 618 aa  269  8e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  29.37 
 
 		 618 aa  269  8e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  35.32 
 
 		 536 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  33.33 
 
 		 636 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  37.02 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  32.24 
 
 		 616 aa  261  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  36.74 
 
 		 599 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  36.74 
 
 		 599 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  36.13 
 
 		 640 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  36.13 
 
 		 640 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  34.69 
 
 		 542 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  31.38 
 
 		 614 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  41.14 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  41.28 
 
 		 497 aa  223  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  35.77 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 		 550 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  31.06 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 		 560 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.29 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.65 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  30.4 
 
 		 649 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  30.37 
 
 		 561 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  32.6 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  32.6 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  32.6 
 
 		 497 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  34.07 
 
 		 617 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  37.65 
 
 		 322 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 		 617 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  33.85 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  28.47 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.94 
 
 		 567 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  28.46 
 
 		 555 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  28.31 
 
 		 663 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.14 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.4 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.18 
 
 		 481 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  31.6 
 
 		 733 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  30.23 
 
 		 677 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  30.23 
 
 		 652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  30.23 
 
 		 652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  30.23 
 
 		 652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  29.19 
 
 		 810 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 636 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  27.41 
 
 		 653 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.93 
 
 		 721 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  25.34 
 
 		 677 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  26.23 
 
 		 902 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  27.15 
 
 		 704 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  29.31 
 
 		 575 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 662 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 662 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.65 
 
 		 900 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.65 
 
 		 900 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.38 
 
 		 670 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 905 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 905 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 905 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 905 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 		 905 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  25.92 
 
 		 902 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  27.15 
 
 		 724 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  25.05 
 
 		 697 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 690 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  24.24 
 
 		 716 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  26.38 
 
 		 672 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  25.7 
 
 		 922 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  27.56 
 
 		 626 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  29.32 
 
 		 725 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  25.23 
 
 		 907 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>