110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2931 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  100 
 
 		 672 aa  1374    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  41.03 
 
 		 696 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  38.71 
 
 		 696 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  37.8 
 
 		 697 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  36.33 
 
 		 721 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  36.33 
 
 		 721 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  37.3 
 
 		 721 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  35.75 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  34.49 
 
 		 743 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  36.02 
 
 		 722 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  35.97 
 
 		 690 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  33.96 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  32.98 
 
 		 742 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  31.52 
 
 		 730 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  33.56 
 
 		 728 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  29.89 
 
 		 717 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  38.41 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  31.84 
 
 		 735 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  33.45 
 
 		 728 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  34.26 
 
 		 725 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  27.98 
 
 		 723 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  29.38 
 
 		 723 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  32.18 
 
 		 806 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  23.57 
 
 		 735 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  27.83 
 
 		 536 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  23.13 
 
 		 748 aa  100  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 618 aa  99.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 618 aa  99.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.28 
 
 		 618 aa  91.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.22 
 
 		 552 aa  90.9  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  24.7 
 
 		 724 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.57 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.58 
 
 		 258 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  26.92 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.54 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  25.53 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.33 
 
 		 625 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  29 
 
 		 554 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  24.2 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.3 
 
 		 626 aa  67  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  32.5 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.85 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.85 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.34 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25.58 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  22.2 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.6 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  25.55 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  27.87 
 
 		 663 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  31.25 
 
 		 572 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  31.25 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.79 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  23.42 
 
 		 649 aa  62  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  23.91 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.44 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.71 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.71 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.71 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.71 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  22.36 
 
 		 670 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.19 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  22.12 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  22.12 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.54 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  22.65 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  21.77 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  26.63 
 
 		 581 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.44 
 
 		 575 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.44 
 
 		 662 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.44 
 
 		 662 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  29.38 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  23.43 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  23.43 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 		 382 aa  55.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  23.33 
 
 		 595 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.54 
 
 		 617 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  25.06 
 
 		 733 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  24.84 
 
 		 497 aa  54.3  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 		 810 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.83 
 
 		 650 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  21.41 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  25.91 
 
 		 561 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  30.49 
 
 		 523 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 617 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  21.51 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  21.51 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  21.51 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  24.02 
 
 		 715 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  24.02 
 
 		 715 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  21.33 
 
 		 653 aa  48.9  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  37.5 
 
 		 322 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.03 
 
 		 480 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.03 
 
 		 480 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  21.74 
 
 		 782 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>