66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6942 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  100 
 
 		 724 aa  1489    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  24.5 
 
 		 735 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  21.14 
 
 		 728 aa  94.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  25.68 
 
 		 723 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  24.07 
 
 		 730 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  22.32 
 
 		 690 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  22.91 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  28.39 
 
 		 723 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  23.08 
 
 		 716 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  24.7 
 
 		 672 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  23.49 
 
 		 697 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  24.08 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  22.99 
 
 		 728 aa  81.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  24.92 
 
 		 696 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  23.95 
 
 		 690 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  24.23 
 
 		 742 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  23.28 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  20.09 
 
 		 743 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  23.3 
 
 		 717 aa  74.3  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  26.76 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  28.78 
 
 		 548 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  23.74 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  23.74 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0256  hypothetical protein  32.12 
 
 		 750 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  20.98 
 
 		 735 aa  65.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  22.73 
 
 		 722 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  23.31 
 
 		 806 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  27.09 
 
 		 900 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  27.09 
 
 		 900 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  29.57 
 
 		 902 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  26.44 
 
 		 611 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.36 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.36 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  26.4 
 
 		 917 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 617 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  30.25 
 
 		 721 aa  50.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  30.51 
 
 		 626 aa  50.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  31.36 
 
 		 552 aa  50.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  21.98 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  29.75 
 
 		 560 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  27.97 
 
 		 497 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  28.1 
 
 		 509 aa  48.5  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  28.1 
 
 		 572 aa  48.5  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  28.1 
 
 		 562 aa  48.5  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  30.09 
 
 		 902 aa  48.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.58 
 
 		 541 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.58 
 
 		 541 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.58 
 
 		 541 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.58 
 
 		 541 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  28.81 
 
 		 547 aa  47.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.78 
 
 		 480 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.78 
 
 		 480 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 905 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 905 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 905 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 905 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 782 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 905 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  25.69 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.39 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  27.64 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.24 
 
 		 733 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.86 
 
 		 625 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.27 
 
 		 422 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 536 aa  44.3  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>