105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4326 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1114    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  34.41 
 
 		 721 aa  258  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  31.19 
 
 		 735 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  32.33 
 
 		 728 aa  248  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  31.48 
 
 		 690 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  30.41 
 
 		 722 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  29.65 
 
 		 723 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  31.86 
 
 		 743 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  28.68 
 
 		 730 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  30.35 
 
 		 723 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  29.96 
 
 		 721 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  29.96 
 
 		 721 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  29.28 
 
 		 696 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  28.54 
 
 		 717 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  27.61 
 
 		 742 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  27.41 
 
 		 697 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  27.31 
 
 		 716 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 		 690 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  30.59 
 
 		 728 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  36.73 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  30.98 
 
 		 696 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  27.83 
 
 		 672 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  27.66 
 
 		 725 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  27.43 
 
 		 748 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  23.56 
 
 		 735 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  29.71 
 
 		 806 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.95 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  27.56 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.95 
 
 		 636 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  28.26 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  28.26 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  26.76 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  29.95 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  28.8 
 
 		 551 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  32.04 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  32.04 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  32.04 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  32.04 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  29.79 
 
 		 595 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  28.02 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  28.65 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  28.65 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  28.65 
 
 		 652 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.43 
 
 		 721 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  30.81 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  29.31 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  27.27 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  28.71 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  28.09 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  26.75 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  27.92 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  27.92 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  23.5 
 
 		 670 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  29.32 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  25 
 
 		 616 aa  62.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.2 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  29.36 
 
 		 670 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  30.73 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.91 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  24.48 
 
 		 886 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.9 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  25.67 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  29.45 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.23 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  29.38 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  28.65 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  28.18 
 
 		 625 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.42 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 		 560 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.9 
 
 		 558 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.12 
 
 		 497 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.12 
 
 		 497 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.12 
 
 		 497 aa  54.3  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.9 
 
 		 558 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  26.11 
 
 		 907 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  25 
 
 		 917 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 905 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 905 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 905 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 905 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  25.36 
 
 		 905 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  24.24 
 
 		 900 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  24.24 
 
 		 900 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25.62 
 
 		 480 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  28.12 
 
 		 614 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  26.67 
 
 		 644 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  23.5 
 
 		 626 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.5 
 
 		 630 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.82 
 
 		 653 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 599 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  29.35 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 599 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>