116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0175 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  100 
 
 
716 aa  1481    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  43.89 
 
 
721 aa  592  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  43.96 
 
 
743 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  43.76 
 
 
690 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  40.83 
 
 
742 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  39.77 
 
 
730 aa  505  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  37.56 
 
 
721 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  37.56 
 
 
721 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  39.62 
 
 
722 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  36.51 
 
 
728 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  32.87 
 
 
696 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  33.19 
 
 
735 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  34.29 
 
 
717 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  44.79 
 
 
447 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  33.96 
 
 
672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  30.8 
 
 
696 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  29.11 
 
 
697 aa  319  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  32.24 
 
 
690 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  27.73 
 
 
728 aa  294  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  29.67 
 
 
723 aa  292  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  31.65 
 
 
725 aa  273  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  29.65 
 
 
723 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  27.31 
 
 
536 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  36.68 
 
 
258 aa  157  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  23.79 
 
 
735 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  29.74 
 
 
806 aa  145  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  23.03 
 
 
748 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.32 
 
 
625 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.24 
 
 
552 aa  98.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.12 
 
 
618 aa  94.4  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  21.37 
 
 
618 aa  93.2  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  21.37 
 
 
618 aa  93.2  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 
636 aa  91.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  23.71 
 
 
547 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  21.89 
 
 
556 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  21.89 
 
 
556 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  21.89 
 
 
556 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  21.89 
 
 
556 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  23.08 
 
 
724 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  25.91 
 
 
558 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.91 
 
 
558 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  25.16 
 
 
670 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.5 
 
 
548 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.57 
 
 
721 aa  80.5  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  20.66 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.57 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  28.16 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  28.16 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  28.16 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  22.25 
 
 
560 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.78 
 
 
651 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  22.98 
 
 
599 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  22.98 
 
 
599 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  23.39 
 
 
560 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.53 
 
 
617 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  20.16 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  21.33 
 
 
595 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.67 
 
 
581 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.32 
 
 
649 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  22.12 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  22.68 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  22.85 
 
 
617 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  19.11 
 
 
640 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  21.26 
 
 
509 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  21.26 
 
 
572 aa  67.4  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  20.37 
 
 
497 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  21.26 
 
 
562 aa  67  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.59 
 
 
663 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.68 
 
 
497 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.68 
 
 
497 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.68 
 
 
497 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  20.27 
 
 
560 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  20.93 
 
 
810 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  22.74 
 
 
555 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.54 
 
 
652 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.54 
 
 
652 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.54 
 
 
652 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.54 
 
 
677 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  19.01 
 
 
640 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  19.01 
 
 
640 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  23.68 
 
 
677 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  27.81 
 
 
542 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  22.37 
 
 
567 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  21.83 
 
 
614 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  19.34 
 
 
632 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 
382 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  22.19 
 
 
626 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  22.11 
 
 
422 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  21.28 
 
 
630 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 
785 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  19.05 
 
 
640 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  22.02 
 
 
611 aa  57  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  19.82 
 
 
468 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.01 
 
 
481 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  22.19 
 
 
782 aa  55.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  25.35 
 
 
907 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>