23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1875 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1875  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  100 
 
 		 258 aa  526  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  51 
 
 		 721 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  43.63 
 
 		 742 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  44.96 
 
 		 690 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  42.8 
 
 		 743 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  36.68 
 
 		 716 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  34.9 
 
 		 728 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  34.92 
 
 		 730 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  32.06 
 
 		 721 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  32.06 
 
 		 721 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  29.77 
 
 		 722 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 696 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  29.53 
 
 		 717 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  33.53 
 
 		 696 aa  99.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 		 690 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  28.12 
 
 		 735 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  31.22 
 
 		 697 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  26.58 
 
 		 672 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  25.31 
 
 		 723 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  30.27 
 
 		 723 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  29.31 
 
 		 536 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  24.34 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  24.55 
 
 		 728 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>