153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5369 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  47.11 
 
 		 905 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  47.11 
 
 		 905 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  100 
 
 		 907 aa  1894    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  47.11 
 
 		 905 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  47.11 
 
 		 905 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  47.11 
 
 		 905 aa  783    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  50 
 
 		 917 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 922 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  46.33 
 
 		 886 aa  746    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  31.39 
 
 		 902 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  32.88 
 
 		 900 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  32.88 
 
 		 900 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  30.16 
 
 		 902 aa  389  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  31.01 
 
 		 947 aa  353  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  30.48 
 
 		 960 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 1010 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 976 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  29.33 
 
 		 904 aa  286  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  27.74 
 
 		 876 aa  283  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 618 aa  125  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  25.3 
 
 		 625 aa  124  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  26.27 
 
 		 794 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  24.3 
 
 		 618 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  24.3 
 
 		 618 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 614 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.71 
 
 		 626 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.16 
 
 		 632 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.16 
 
 		 640 aa  101  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.38 
 
 		 616 aa  100  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.65 
 
 		 611 aa  99.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25 
 
 		 630 aa  98.2  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  25.96 
 
 		 640 aa  95.9  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25.23 
 
 		 552 aa  95.1  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25.74 
 
 		 481 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.07 
 
 		 481 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.21 
 
 		 497 aa  93.2  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.21 
 
 		 497 aa  93.2  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.21 
 
 		 497 aa  93.2  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.26 
 
 		 547 aa  91.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  26.67 
 
 		 640 aa  90.1  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  26.67 
 
 		 640 aa  90.1  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.04 
 
 		 536 aa  89  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 		 547 aa  88.6  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 480 aa  87.8  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.56 
 
 		 480 aa  87.8  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  33.01 
 
 		 560 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  24.55 
 
 		 733 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.46 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.71 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  24.65 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.44 
 
 		 555 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  26.89 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.2 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 551 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.2 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.07 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.07 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.07 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.61 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.6 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.53 
 
 		 561 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 556 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 556 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.19 
 
 		 556 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.3 
 
 		 556 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.03 
 
 		 652 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.03 
 
 		 652 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.03 
 
 		 652 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.03 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  24.25 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  23.66 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  23.97 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.1 
 
 		 595 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  27.9 
 
 		 581 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  27.12 
 
 		 322 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  25.82 
 
 		 650 aa  77  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  33.78 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  22.96 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.27 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.08 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.08 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.87 
 
 		 721 aa  73.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 785 aa  72.8  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  24.91 
 
 		 550 aa  71.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  21.68 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  21.68 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  21.68 
 
 		 662 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  27.43 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  27.7 
 
 		 636 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.74 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  23.51 
 
 		 718 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  22.92 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.37 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  22.99 
 
 		 704 aa  61.6  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  25.14 
 
 		 447 aa  60.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>