101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0544 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  100 
 
 		 947 aa  1968    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  30.41 
 
 		 886 aa  356  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  31.01 
 
 		 907 aa  353  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  30.64 
 
 		 917 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  29.72 
 
 		 905 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  29.72 
 
 		 905 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  29.72 
 
 		 905 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  29.72 
 
 		 905 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  29.72 
 
 		 905 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  30.24 
 
 		 922 aa  314  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  27.03 
 
 		 900 aa  260  8e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  27.03 
 
 		 900 aa  260  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  27.68 
 
 		 902 aa  257  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  27.54 
 
 		 902 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 976 aa  214  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 1010 aa  214  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  26.71 
 
 		 960 aa  204  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  23.24 
 
 		 876 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  24.08 
 
 		 904 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  22.26 
 
 		 618 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.18 
 
 		 552 aa  90.1  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  23.87 
 
 		 794 aa  89.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 		 618 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 		 618 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 614 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.59 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.74 
 
 		 625 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.36 
 
 		 547 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  24.87 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  24.15 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  23.31 
 
 		 611 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  23.76 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 509 aa  73.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  26.69 
 
 		 572 aa  74.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  26.69 
 
 		 562 aa  74.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  24.65 
 
 		 595 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 599 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  24.54 
 
 		 599 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.43 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.35 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.35 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  24.55 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  25.64 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.03 
 
 		 561 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  24.79 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  24.79 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.55 
 
 		 542 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  23.73 
 
 		 626 aa  67.4  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  20.04 
 
 		 616 aa  66.6  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  30.36 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  22.5 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 551 aa  65.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.61 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  27.22 
 
 		 782 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  25.07 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.64 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.64 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.64 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.64 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  26.48 
 
 		 560 aa  60.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  22.04 
 
 		 422 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.5 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  22.68 
 
 		 785 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  21.77 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 541 aa  57  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 541 aa  57  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 541 aa  57  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.52 
 
 		 541 aa  57  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  22.73 
 
 		 640 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  22.73 
 
 		 632 aa  57  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.32 
 
 		 663 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  23.45 
 
 		 550 aa  54.7  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  22.96 
 
 		 581 aa  54.7  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.49 
 
 		 649 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  24.55 
 
 		 733 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  25.77 
 
 		 704 aa  53.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  26.54 
 
 		 670 aa  52.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  23.55 
 
 		 650 aa  51.6  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  18.38 
 
 		 662 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  18.38 
 
 		 662 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  18.26 
 
 		 575 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 617 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  20.12 
 
 		 480 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  20.12 
 
 		 480 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  21.72 
 
 		 644 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  24.09 
 
 		 468 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 634 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 634 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  27.12 
 
 		 617 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  23.41 
 
 		 300 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  24.12 
 
 		 782 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  22.77 
 
 		 567 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.73 
 
 		 481 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.73 
 
 		 481 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  26.9 
 
 		 497 aa  44.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>