135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0613 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 634 aa  1273    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 634 aa  1273    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  77.82 
 
 		 539 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2020  hypothetical protein  56.72 
 
 		 560 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  45.37 
 
 		 829 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  32.37 
 
 		 523 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 715 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 715 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  28.15 
 
 		 749 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3220  hypothetical protein  54.49 
 
 		 172 aa  171  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112254  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  27.95 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  30.56 
 
 		 628 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24.43 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  27.46 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  24.25 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.9 
 
 		 810 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  25.59 
 
 		 554 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  25.11 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.79 
 
 		 581 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.7 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.7 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.98 
 
 		 560 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25.79 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.25 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  27.36 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.91 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.91 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  23.68 
 
 		 663 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25.18 
 
 		 536 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  24.24 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  25.12 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.64 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.91 
 
 		 721 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  23.48 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 630 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  29.22 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  25.56 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  25.27 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.83 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  22.86 
 
 		 900 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  24.85 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  22.67 
 
 		 653 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  22.86 
 
 		 900 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.44 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  27.11 
 
 		 718 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  21.96 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  21.96 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  23.18 
 
 		 922 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  24.66 
 
 		 754 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  23.37 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  22.25 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  23.97 
 
 		 738 aa  57.4  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  23.1 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 		 560 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  27.15 
 
 		 794 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  26.29 
 
 		 791 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  25.35 
 
 		 650 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  24.8 
 
 		 738 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  25.93 
 
 		 489 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  20.91 
 
 		 611 aa  53.9  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  23.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  23.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  23.47 
 
 		 417 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  26.33 
 
 		 550 aa  53.9  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 917 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  26.24 
 
 		 704 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.55 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.55 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.55 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.55 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  24.6 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  23.19 
 
 		 947 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  25.6 
 
 		 499 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  25.6 
 
 		 499 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  25.6 
 
 		 499 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  25.6 
 
 		 499 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  24.54 
 
 		 493 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  24.54 
 
 		 493 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  25.51 
 
 		 456 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  23.98 
 
 		 724 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.67 
 
 		 677 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.67 
 
 		 652 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.67 
 
 		 652 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.67 
 
 		 652 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  23.1 
 
 		 902 aa  50.8  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 522 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  22.92 
 
 		 441 aa  50.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  22.92 
 
 		 441 aa  50.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  22.92 
 
 		 441 aa  50.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  22.92 
 
 		 441 aa  50.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 547 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>