102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3568 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  100 
 
 
794 aa  1625    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  29.68 
 
 
902 aa  157  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  29.83 
 
 
900 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  29.83 
 
 
900 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  25.48 
 
 
886 aa  140  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
905 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
905 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
905 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
905 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  27.13 
 
 
905 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  30.37 
 
 
902 aa  137  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  24.88 
 
 
876 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  31.77 
 
 
922 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  25.55 
 
 
917 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  26.27 
 
 
907 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  27.68 
 
 
960 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  29.06 
 
 
617 aa  92  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.21 
 
 
617 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  26.83 
 
 
1010 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  26.83 
 
 
976 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  23.87 
 
 
947 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  22.74 
 
 
618 aa  82  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  31.61 
 
 
904 aa  81.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.34 
 
 
547 aa  79.7  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  29.07 
 
 
552 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.65 
 
 
810 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.35 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.35 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.35 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.35 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.73 
 
 
575 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.13 
 
 
636 aa  67.4  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  28.65 
 
 
497 aa  65.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.47 
 
 
650 aa  65.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  23.53 
 
 
536 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 
599 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 
599 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  30.67 
 
 
548 aa  61.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  26.54 
 
 
547 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.49 
 
 
649 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.87 
 
 
542 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  28.67 
 
 
636 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  21.05 
 
 
618 aa  58.2  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  21.05 
 
 
618 aa  58.2  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  26.78 
 
 
558 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  26.78 
 
 
558 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  24.69 
 
 
630 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.23 
 
 
626 aa  56.6  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25.95 
 
 
480 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25.95 
 
 
480 aa  55.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  26.49 
 
 
551 aa  55.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  26.05 
 
 
670 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.23 
 
 
561 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 
556 aa  55.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  27.46 
 
 
785 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 
556 aa  55.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 
556 aa  55.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 
556 aa  55.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 
634 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  27.15 
 
 
634 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 
551 aa  54.3  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  25.17 
 
 
754 aa  54.3  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  23.57 
 
 
595 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  23.14 
 
 
616 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  29.22 
 
 
614 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.65 
 
 
677 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.47 
 
 
560 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.56 
 
 
625 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.67 
 
 
382 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.65 
 
 
652 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.65 
 
 
652 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.65 
 
 
652 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  27.87 
 
 
626 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 
550 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  38.71 
 
 
333 aa  51.6  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  28.47 
 
 
497 aa  51.2  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  28.47 
 
 
497 aa  51.2  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  28.47 
 
 
497 aa  51.2  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  27.23 
 
 
562 aa  51.2  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 
509 aa  50.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  27.8 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  27.23 
 
 
572 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.67 
 
 
481 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  21.55 
 
 
721 aa  49.3  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.38 
 
 
555 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26.11 
 
 
481 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0378  hypothetical protein  35.05 
 
 
205 aa  48.9  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  27.1 
 
 
554 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  28.35 
 
 
567 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.2 
 
 
581 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  26.84 
 
 
782 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  26.05 
 
 
539 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  23.62 
 
 
733 aa  46.2  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  34.38 
 
 
493 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  34.38 
 
 
493 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  34.38 
 
 
495 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  28.04 
 
 
715 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  28.04 
 
 
715 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.751819 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>