125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1659 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  41.03 
 
 		 907 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  100 
 
 		 922 aa  1928    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 905 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 905 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 905 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 905 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 905 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  39.06 
 
 		 886 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  39.17 
 
 		 917 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  31.26 
 
 		 902 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  31.17 
 
 		 900 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  31.17 
 
 		 900 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  29.58 
 
 		 902 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  30.24 
 
 		 947 aa  314  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  28.89 
 
 		 976 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  28.89 
 
 		 1010 aa  291  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  27.7 
 
 		 876 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 960 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  26.96 
 
 		 904 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.54 
 
 		 618 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  31.77 
 
 		 794 aa  129  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 618 aa  110  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 556 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  24.28 
 
 		 640 aa  105  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.73 
 
 		 626 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.51 
 
 		 625 aa  99.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25.7 
 
 		 552 aa  97.4  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.21 
 
 		 614 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.93 
 
 		 630 aa  95.5  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.59 
 
 		 547 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.53 
 
 		 595 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  27.5 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  23.68 
 
 		 640 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  23.68 
 
 		 640 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  24.26 
 
 		 640 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.58 
 
 		 632 aa  92  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  25.59 
 
 		 611 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.44 
 
 		 649 aa  88.6  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  22.42 
 
 		 616 aa  87.8  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  25.08 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.47 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.59 
 
 		 721 aa  84.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.55 
 
 		 536 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.99 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.99 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.99 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.99 
 
 		 541 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.75 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.45 
 
 		 542 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  26.49 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.17 
 
 		 617 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  27.13 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  24.08 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 		 581 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  26.67 
 
 		 322 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.91 
 
 		 662 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.91 
 
 		 662 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.91 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  24.64 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  24.64 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.35 
 
 		 644 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.36 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  25.28 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.36 
 
 		 652 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.36 
 
 		 652 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.36 
 
 		 652 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.8 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.8 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.8 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  24.74 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  22.69 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  23.97 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  23.64 
 
 		 560 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  27.05 
 
 		 558 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  27.86 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  22.9 
 
 		 555 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  27.05 
 
 		 558 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  22.98 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.82 
 
 		 567 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  24.35 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.26 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  21.05 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  21.05 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  21.05 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  28.51 
 
 		 785 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  23.61 
 
 		 554 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 791 aa  65.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06222  hypothetical protein  25.94 
 
 		 300 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  22.11 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  23.37 
 
 		 626 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  24.58 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  24.83 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  23.43 
 
 		 704 aa  59.3  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>