74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1038 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 904 aa  1869    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.863705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  27.01 
 
 		 886 aa  320  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  29.23 
 
 		 907 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 905 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 905 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 905 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 905 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 905 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  27.42 
 
 		 917 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  28.48 
 
 		 902 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  27.16 
 
 		 922 aa  225  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  27.3 
 
 		 900 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  27.3 
 
 		 900 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  26.75 
 
 		 902 aa  217  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0544  integrase catalytic region  23.62 
 
 		 947 aa  158  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  22.92 
 
 		 876 aa  139  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  23.54 
 
 		 960 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  25.06 
 
 		 1010 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  25.06 
 
 		 976 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  24.89 
 
 		 618 aa  93.2  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  24.89 
 
 		 618 aa  93.2  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  22.63 
 
 		 618 aa  90.5  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  23.85 
 
 		 640 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  23.33 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 		 541 aa  84  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  23.33 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  31.61 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  28.07 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  22.86 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  23.85 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  29.27 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  22.81 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.9 
 
 		 547 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.28 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  25 
 
 		 626 aa  67  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.87 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  26.29 
 
 		 670 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  28.31 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25.2 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  24.66 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  23.67 
 
 		 630 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2177  integrase catalytic region  27.32 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.68768  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 599 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.62 
 
 		 599 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.84 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  23.91 
 
 		 649 aa  57.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  24.65 
 
 		 551 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  23.8 
 
 		 614 aa  57  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  24.31 
 
 		 617 aa  55.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.52 
 
 		 595 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  21.71 
 
 		 650 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  22.97 
 
 		 536 aa  51.2  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  25.6 
 
 		 617 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  23.88 
 
 		 733 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  25.79 
 
 		 785 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  25.13 
 
 		 626 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  26.67 
 
 		 382 aa  47.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  28.19 
 
 		 416 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  30.1 
 
 		 341 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  24.91 
 
 		 554 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.21 
 
 		 636 aa  45.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  22.66 
 
 		 636 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  24.45 
 
 		 782 aa  45.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 417 aa  45.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 417 aa  45.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 417 aa  45.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  21.43 
 
 		 616 aa  45.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>