163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3210 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 782 aa  1587    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  29.41 
 
 		 704 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  29.05 
 
 		 749 aa  231  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  29.3 
 
 		 762 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  32.31 
 
 		 754 aa  221  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  32.27 
 
 		 710 aa  204  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  28.94 
 
 		 774 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  27.12 
 
 		 780 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  28.96 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 		 810 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  26.61 
 
 		 677 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.97 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.97 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  26.18 
 
 		 649 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  24.12 
 
 		 618 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  24.12 
 
 		 618 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 556 aa  111  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 556 aa  111  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 556 aa  111  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  27.7 
 
 		 556 aa  111  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  26.55 
 
 		 640 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  26.4 
 
 		 640 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  27.3 
 
 		 548 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  26.55 
 
 		 640 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.61 
 
 		 551 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  20.97 
 
 		 618 aa  103  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.29 
 
 		 617 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  26.24 
 
 		 422 aa  99  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  24.9 
 
 		 626 aa  98.2  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  24.55 
 
 		 572 aa  98.2  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  24.55 
 
 		 562 aa  98.2  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 		 509 aa  97.8  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  22.72 
 
 		 653 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.87 
 
 		 617 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  29.14 
 
 		 552 aa  96.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  23.97 
 
 		 625 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  24.11 
 
 		 560 aa  95.9  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  25.51 
 
 		 630 aa  95.9  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 547 aa  94.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  26.21 
 
 		 547 aa  93.2  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 541 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 541 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 541 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 541 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  25.47 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  27.5 
 
 		 333 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  23.1 
 
 		 616 aa  88.6  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  22.29 
 
 		 632 aa  87.8  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.68 
 
 		 721 aa  87  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  24.04 
 
 		 733 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  24.05 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.87 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  24.19 
 
 		 575 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  24.19 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  24.19 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.88 
 
 		 651 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  26.29 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  25.12 
 
 		 614 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  22.67 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  24.92 
 
 		 785 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  23.66 
 
 		 917 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  28.11 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.03 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.03 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  26.37 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  25 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 		 782 aa  71.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  30.26 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.66 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 905 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 905 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 905 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 905 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  23.79 
 
 		 905 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  28.96 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  28.96 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  27.09 
 
 		 539 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  28.2 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  25.54 
 
 		 382 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  27.9 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  27.9 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  27.9 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  23.89 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  20.43 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  23.68 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.48 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  25.13 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  28.85 
 
 		 581 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  26.24 
 
 		 291 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.52 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  20.5 
 
 		 791 aa  63.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.63 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  29.77 
 
 		 510 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 634 aa  62  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 634 aa  62  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  32.58 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  24.01 
 
 		 487 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>