91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3108 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  100 
 
 		 735 aa  1519    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  26.91 
 
 		 697 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  29.55 
 
 		 721 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  27.05 
 
 		 735 aa  183  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  25.11 
 
 		 721 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  25.11 
 
 		 721 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2326  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  25.55 
 
 		 743 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3487  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.7 
 
 		 742 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.054848  normal  0.0804563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  24.44 
 
 		 690 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3827  transposon Tn7 transposition protein TnsB  26.54 
 
 		 696 aa  173  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111993 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1202  Tn5468, transposase protein B  23.57 
 
 		 722 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0183  Tn7-like transposition protein B  26.53 
 
 		 730 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3946  integrase catalytic subunit  26.7 
 
 		 696 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  23.79 
 
 		 716 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0246  Integrase catalytic region  24.71 
 
 		 717 aa  156  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.337678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2931  putative transposase  23.57 
 
 		 672 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0221  Tn7-like transposition protein B  22.79 
 
 		 728 aa  150  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.26166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  28.7 
 
 		 723 aa  147  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 690 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1873  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  30.48 
 
 		 447 aa  132  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.701975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1175  hypothetical protein  25.13 
 
 		 748 aa  125  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  24.67 
 
 		 723 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4326  hypothetical protein  23.56 
 
 		 536 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  26.79 
 
 		 728 aa  111  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5458  Tn7-like transposase  26.32 
 
 		 725 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  24.07 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.82 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  20.98 
 
 		 724 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  27.49 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  26.58 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.32 
 
 		 560 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  23.2 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  23.2 
 
 		 562 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  29.37 
 
 		 572 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  21.69 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.25 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.25 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.62 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  28.68 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.6 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  22.59 
 
 		 650 aa  58.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24.3 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  28.17 
 
 		 810 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.36 
 
 		 536 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  33.01 
 
 		 382 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  23.02 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  23.02 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  22.71 
 
 		 497 aa  55.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 560 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  19.63 
 
 		 581 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  20 
 
 		 541 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  20 
 
 		 541 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  22.05 
 
 		 653 aa  55.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  20 
 
 		 541 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  20 
 
 		 541 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5405  transposase, TnsB-related protein  20 
 
 		 670 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.296253  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  20 
 
 		 632 aa  54.3  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  22.22 
 
 		 677 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.57 
 
 		 617 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  22.86 
 
 		 652 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  22.86 
 
 		 652 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 652 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  30.19 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  23.7 
 
 		 626 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  22.67 
 
 		 555 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  21.27 
 
 		 625 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.39 
 
 		 640 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  22.43 
 
 		 567 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.38 
 
 		 481 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  22.54 
 
 		 547 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  31.87 
 
 		 556 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  31.87 
 
 		 556 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  31.87 
 
 		 556 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  31.87 
 
 		 556 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.03 
 
 		 481 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.13 
 
 		 552 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  21.92 
 
 		 617 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  31.96 
 
 		 322 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  26.28 
 
 		 547 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 663 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.47 
 
 		 733 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  21.69 
 
 		 618 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  30.61 
 
 		 595 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 480 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 480 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  21.69 
 
 		 618 aa  47  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  21.35 
 
 		 611 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  24.26 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  23.56 
 
 		 651 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2453  Integrase catalytic region  21.58 
 
 		 917 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.481095  hitchhiker  0.00214195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  21.51 
 
 		 616 aa  44.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>