16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0256 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0256  hypothetical protein  100 
 
 
750 aa  1553    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6942  hypothetical protein  25.32 
 
 
724 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62417  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5194  Tn7-like transposition protein B  23.36 
 
 
723 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460323  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5724  Tn7-like transposition protein B  24.56 
 
 
723 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6966  hypothetical protein  26.52 
 
 
728 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  21.28 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7026  Tn7-like transposition protein B  23.65 
 
 
735 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.314697  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3700  hypothetical protein  23.22 
 
 
326 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  27.45 
 
 
721 aa  50.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3108  transposon Tn7 transposition protein B  21.4 
 
 
735 aa  47.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101373 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.81 
 
 
548 aa  47.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  21.13 
 
 
630 aa  48.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 
536 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  21.66 
 
 
618 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  21.66 
 
 
618 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.28 
 
 
625 aa  44.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>