161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5417 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 715 aa  1452    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 715 aa  1452    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  47.2 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  35.83 
 
 		 749 aa  341  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  29.28 
 
 		 829 aa  207  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  31.48 
 
 		 634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  33.06 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  28.34 
 
 		 628 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  29.11 
 
 		 757 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2020  hypothetical protein  27.62 
 
 		 560 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  26.51 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  24.68 
 
 		 618 aa  102  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.15 
 
 		 567 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.35 
 
 		 558 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.35 
 
 		 558 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  27.63 
 
 		 652 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 		 652 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  27.63 
 
 		 652 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  27.63 
 
 		 677 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.47 
 
 		 561 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.16 
 
 		 618 aa  91.3  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.16 
 
 		 618 aa  91.3  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 541 aa  91.3  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 541 aa  91.3  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 541 aa  91.3  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  27.17 
 
 		 541 aa  91.3  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.91 
 
 		 581 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 560 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  27.45 
 
 		 468 aa  88.2  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.88 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.98 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.68 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  23.73 
 
 		 670 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  24.52 
 
 		 630 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.78 
 
 		 548 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  21.82 
 
 		 626 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  28.64 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  28.3 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.43 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  24.81 
 
 		 551 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.36 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.36 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  23.24 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  23.26 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  25.38 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  21.26 
 
 		 611 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.16 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.16 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.16 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.02 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.91 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  25.5 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  26.5 
 
 		 704 aa  69.3  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  24.69 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.7 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  25.34 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  23.66 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  24.48 
 
 		 632 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  23.81 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  20.31 
 
 		 886 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  23.81 
 
 		 562 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  28.22 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  28.5 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  28.44 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  24.41 
 
 		 774 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  22.55 
 
 		 640 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  28.91 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  24.84 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  26.73 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  24.57 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  23.91 
 
 		 677 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  24.75 
 
 		 749 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  25.67 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  28.1 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  30.83 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>