149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06219 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  31.09 
 
 		 617 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  34.4 
 
 		 617 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  28.09 
 
 		 649 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  29.55 
 
 		 677 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 652 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 652 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  29.55 
 
 		 652 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.6 
 
 		 810 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 618 aa  99.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  25.16 
 
 		 618 aa  99.8  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  27.08 
 
 		 548 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  27.24 
 
 		 733 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.33 
 
 		 636 aa  95.9  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  30.09 
 
 		 618 aa  93.2  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 662 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  26.5 
 
 		 662 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  35.37 
 
 		 774 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  26.5 
 
 		 575 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  27.5 
 
 		 782 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  28.18 
 
 		 653 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  22.9 
 
 		 650 aa  85.9  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  28.03 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  28.29 
 
 		 554 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  27.86 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  27.49 
 
 		 782 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  26.47 
 
 		 754 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  28.85 
 
 		 710 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  20.82 
 
 		 625 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  27.86 
 
 		 551 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  28.63 
 
 		 704 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25.71 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.69 
 
 		 616 aa  72.8  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.35 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.89 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  22.67 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 614 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.37 
 
 		 552 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  22.68 
 
 		 721 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  27.59 
 
 		 762 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  24.51 
 
 		 640 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.95 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.95 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.95 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3047  transposase  23.81 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00784211  normal  0.39515 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  26.48 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  23.53 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  22.7 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  27.65 
 
 		 560 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  21.97 
 
 		 560 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  26.55 
 
 		 567 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  24.51 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  24.51 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  25.89 
 
 		 595 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  22.73 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  22.73 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  22.73 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  30.3 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  27.86 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.2 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.2 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  29.51 
 
 		 670 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0187  urease, beta subunit  22.48 
 
 		 611 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  21.61 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  29.51 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  22.75 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 		 791 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.53 
 
 		 481 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  29.58 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  26.67 
 
 		 650 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  23.35 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  25.57 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  26.36 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26.12 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2802  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  21.07 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3198  Tn5468, transposase protein B  21.07 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.649302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  32.32 
 
 		 829 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  21.01 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  32.47 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  23.1 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  24.57 
 
 		 749 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  32.52 
 
 		 644 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  26.24 
 
 		 749 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1859  hypothetical protein  26.92 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 		 581 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 		 785 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3948  HMG-I and HMG-Y DNA-binding domain protein  26.02 
 
 		 690 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>