85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3575 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  100 
 
 		 757 aa  1519    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  37.04 
 
 		 523 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4353  hypothetical protein  61.11 
 
 		 171 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  30.07 
 
 		 829 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 715 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 715 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  30.68 
 
 		 749 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  28.71 
 
 		 634 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  28.71 
 
 		 634 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  31.22 
 
 		 539 aa  152  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  26.75 
 
 		 628 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2020  hypothetical protein  29.57 
 
 		 560 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.32 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.34 
 
 		 555 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.46 
 
 		 567 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  29.59 
 
 		 560 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.34 
 
 		 558 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.05 
 
 		 558 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  24.27 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.15 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.36 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.36 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  22 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.36 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  23.99 
 
 		 721 aa  70.1  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  22.57 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  27.36 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  26.05 
 
 		 550 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  21.43 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  25.52 
 
 		 670 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  21.13 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.15 
 
 		 618 aa  60.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  23.45 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.15 
 
 		 618 aa  60.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  22.99 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  21.99 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  22.46 
 
 		 625 aa  57.4  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.31 
 
 		 653 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.14 
 
 		 536 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  23.44 
 
 		 468 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  21.3 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  21.3 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  21.3 
 
 		 614 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 581 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  27.01 
 
 		 782 aa  54.7  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  22.15 
 
 		 617 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.35 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.35 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.35 
 
 		 652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25.35 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.34 
 
 		 617 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4971  hypothetical protein  29.36 
 
 		 806 aa  52.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  19.89 
 
 		 618 aa  51.6  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0175  Tn7-like transposition protein B  20.88 
 
 		 716 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  20.63 
 
 		 616 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  26.64 
 
 		 599 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  26.64 
 
 		 599 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  22.22 
 
 		 651 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  19.94 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  19.94 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  22.5 
 
 		 562 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  22.5 
 
 		 572 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  24.74 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  24.74 
 
 		 422 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  22.79 
 
 		 636 aa  48.5  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 556 aa  47.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  26.4 
 
 		 382 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  24.87 
 
 		 560 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.55 
 
 		 552 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  24.06 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  26.53 
 
 		 333 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.67 
 
 		 649 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  22.55 
 
 		 709 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.64 
 
 		 542 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  24.61 
 
 		 710 aa  45.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2133  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  44.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992239  normal  0.0302754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  24.57 
 
 		 497 aa  44.3  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>