194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2955 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  100 
 
 		 709 aa  1454    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  40.2 
 
 		 772 aa  365  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  35.86 
 
 		 718 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  34.07 
 
 		 738 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  33.67 
 
 		 738 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  30.83 
 
 		 724 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  35.7 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  27.97 
 
 		 372 aa  108  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  27.39 
 
 		 561 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  25.29 
 
 		 708 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  29.3 
 
 		 558 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  29.3 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  22.75 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  26.67 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.98 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.98 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  25.19 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.44 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.59 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  30.62 
 
 		 560 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.88 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.71 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.71 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.71 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.71 
 
 		 652 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  24.82 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.57 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  28.64 
 
 		 704 aa  63.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.32 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.99 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.99 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.73 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  27.98 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  24.51 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  24.51 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  24.51 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25.17 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.7 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  25.95 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  24.51 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  25.69 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.24 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  24.68 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  31.51 
 
 		 382 aa  57.4  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  27.08 
 
 		 479 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  25.47 
 
 		 653 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  28.05 
 
 		 542 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 663 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  24.47 
 
 		 791 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.23 
 
 		 548 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.29 
 
 		 556 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  24.29 
 
 		 556 aa  54.3  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  24.29 
 
 		 556 aa  54.3  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  24.29 
 
 		 556 aa  54.3  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  23.84 
 
 		 670 aa  54.3  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  29.77 
 
 		 626 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  26.18 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  26.18 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  29.84 
 
 		 749 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  26.18 
 
 		 597 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  28.47 
 
 		 456 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  30.72 
 
 		 595 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  28.03 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  25.65 
 
 		 290 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  25.65 
 
 		 290 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  27.55 
 
 		 269 aa  51.6  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  27.19 
 
 		 630 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  27.55 
 
 		 269 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  25.7 
 
 		 636 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  27.59 
 
 		 551 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1659  Integrase catalytic region  24.58 
 
 		 922 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  22.49 
 
 		 829 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  24.75 
 
 		 251 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  28.46 
 
 		 657 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  28.28 
 
 		 269 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  26.53 
 
 		 900 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  28.28 
 
 		 269 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  26.53 
 
 		 900 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  24.74 
 
 		 266 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 459 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 459 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 459 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 459 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>