More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2257 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  99.78 
 
 		 459 aa  951    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  99.56 
 
 		 459 aa  947    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 459 aa  953    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 459 aa  953    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  99.1 
 
 		 330 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  56.92 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  56.92 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  56.92 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  56.92 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  64.13 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  40.79 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  40.79 
 
 		 417 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  40.79 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  41.52 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3237  hypothetical protein  98.32 
 
 		 119 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 		 426 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  29.62 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 		 522 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  31.78 
 
 		 510 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  31.96 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  26.02 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.49 
 
 		 497 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.49 
 
 		 497 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.49 
 
 		 497 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  25.06 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  25.06 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  25.06 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  25.06 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  25.06 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  25.06 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  24.56 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  24.56 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  27.99 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  27.99 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.86 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26.86 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  25.9 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  23.95 
 
 		 547 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  24.45 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  24 
 
 		 724 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 715 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  28.29 
 
 		 715 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  25.96 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  24.68 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0022  ISChy6, transposase  46.43 
 
 		 61 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  22.81 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  28.75 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  25.1 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  24.09 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0166  putative integrase protein  24.43 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  29.38 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  24.02 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  23 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  23 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  22.81 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>