44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0166 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0166  putative integrase protein  100 
 
 		 553 aa  1152    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0013  integrase, catalytic region  52.29 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13890  putative integrase protein  53.67 
 
 		 336 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216731  normal  0.122609 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6635  putative integrase protein  51.51 
 
 		 373 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000253479  hitchhiker  0.0000000190144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0608  putative integrase protein  49.85 
 
 		 344 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.346201 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0386  phage integrase family site specific recombinase  52.19 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0607  putative integrase protein  60 
 
 		 106 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3697  hypothetical protein  25.1 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  25.99 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  25.99 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  25.99 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  25.99 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  26.19 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  25.8 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  25.8 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  25.8 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  24.43 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  25.26 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  25.35 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  25.26 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  24.43 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  24.43 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  24.43 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  25.43 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  24.57 
 
 		 489 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  25 
 
 		 341 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  27.57 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2273  hypothetical protein  26.43 
 
 		 597 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  27.59 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  29.05 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  28.38 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 522 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  24.38 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1396  hypothetical protein  21.93 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  28.87 
 
 		 480 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  28.87 
 
 		 480 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.4 
 
 		 552 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0606  hypothetical protein  36.67 
 
 		 81 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.171846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  28 
 
 		 328 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  27.81 
 
 		 328 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>